Pagrindinis FISH ir CGH skirtumas yra tas, kad FISH yra molekulinė technika, kuri aptinka specifinę DNR seką chromosomoje naudojant fluorescenciniu būdu pažymėtus zondus, o CGH yra kita molekulinė citogenetinė technika, aptinkanti genominės DNR pakitimus.
Citogenetinė analizė atlieka svarbų vaidmenį medicinoje nustatant chromosomų anomalijas, tokias kaip aneuploidijos, delecijos, dubliacijos, persitvarkymai ir kt. Chromosomų anomalijos galiausiai sukelia genetines ligas, tokias kaip vėžys, nevaisingumas, Dauno sindromas, Klinefelterio sindromas, Turnerio sindromas. sindromas, leukemija ir kt. Yra įvairių molekulinės citogenetikos metodų, leidžiančių nustatyti aukščiau paminėtus defektus ir ligas. Tarp jų FISH (fluorescencinė in situ hibridizacija) ir CGH (lyginamoji genomo hibridizacija) yra du galingi hibridizacijos metodai. Tačiau abu metodai turi privalumų ir trūkumų.
Kas yra ŽUVYS?
FISH yra nukleorūgščių hibridizacijos technika, atliekama tam tikrai audinio daliai ar daliai visame audinyje arba ląstelėse. Tai zondu pagrįstas metodas. Metodas priklauso nuo Watson Crick komplementarių bazių poravimo teorijos, dėl kurios susidaro arba DNR – DNR hibridai, arba DNR – RNR hibridai, kurie gali aptikti mutavusius genus arba identifikuoti dominantį geną. Be to, taikant šią techniką kaip zondai, papildantys dominančias genų sekas, naudojamos vienos grandinės DNR sekos, dvigrandės DNR sekos, vienos grandinės RNR sekos arba sintetinis oligonukleotidas, paruoštas naudojant nick transliaciją. Be to, svarbiausia šios technikos savybė yra zondų ženklinimas fluorescenciniais dažais. Taigi zondai jungiasi su papildomomis chromosomos dalimis ir palengvina aptikimą.
Be to, FISH yra labai jautrus ir specifinis metodas. Taigi tai yra įprastas metodas tiriant ir diagnozuojant piktybinius hematologinius ir solidinius navikus. Tačiau FISH rodo mažą skiriamąją gebą. Norint sukurti zondo sekas, taip pat reikia išankstinių žinių apie tikslinę anomaliją.
01 pav.: ŽUVYS
Yra daug FISH pritaikymo būdų, daugiausia infekcinių ligų molekulinėje diagnostikoje, siekiant nustatyti patogenų buvimą ir patvirtinti patogeną naudojant molekulinę diagnostiką. Be to, FISH yra plačiai naudojamas metodas vystymosi biologijos, kariotipų nustatymo ir filogenetinės analizės bei fizinio chromosomų kartografavimo srityse.
Kas yra CGH?
Lyginamoji genomo hibridizacija (CGH) yra dar vienas DNR pagrįstas molekulinės citogenetikos metodas, galintis aptikti genominės DNR sekų pakitimus. Šis metodas yra pažangus metodas, kuriuo galima analizuoti chromosomų ir genų modifikacijas, siekiant nustatyti genominės DNR sekos pokyčius ar pakitimus. Be to, CGH reikalauja išskirti ir suskaidyti DNR iš eksperimentinio mėginio ir etaloninio mėginio. Tada mėginiai turėtų būti pažymėti dviem skirtingais fluorescenciniais dažais (dažniausiai raudona ir žalia). Vėliau abu mėginiai sumaišomi ir leidžiami konkurencinei hibridizacijai. Paskutinis žingsnis yra mėginių analizė, siekiant nustatyti DNR pakitimus, tokius kaip genų dubliavimas, genų praradimas ir tt. Ypač išmatuojami DNR kopijų skaičiaus skirtumai tarp tiriamojo ir kontrolinio mėginio.
02 pav.: CGH
Dabar pasiekiama kita CGH versija; tai pažangesnis metodas nei įprastas CGH. Tai technika, vadinama masyvu pagrįsta CGH arba aCGH. aCGH leidžia tiksliai identifikuoti genų arba sekos delecijas daugelyje tūkstančių sekų viename eksperimente.
Kokie yra FISH ir CGH panašumai?
- FISH ir CGH yra du molekuliniai metodai.
- Tiek FISH, tiek CGH priklauso nuo nukleorūgščių hibridizacijos.
- Be to, abiems technologijoms reikalingi zondai, skirti aptikti specifinius DNR taikinius.
- Jas naudojame genetinių ligų prenatalinei ir postnatalinei diagnostikai.
- Be to, FISH ir CGH yra labai galingi įrankiai genominiams pakitimams tirti.
- Jie naudoja fluorescencinius dažus zondams žymėti.
Kuo skiriasi FISH ir CGH?
FISH yra in situ hibridizacijos procedūra, kurios metu naudojami fluorescenciniai zondai specifinėms DNR sekoms aptikti, o CGH yra molekulinės hibridizacijos technika, aptinkanti genominės DNR sekų pakitimus. Taigi, tai yra pagrindinis FISH ir CGH skirtumas.
Be to, norint sukurti zondo sekas, FISH reikalauja išankstinių žinių apie tikslinę anomaliją, o CGH nereikalauja išankstinių žinių. Be to, dar vienas skirtumas tarp FISH ir CGH yra tas, kad FISH rodo ribotą skyrą, o aCGH – didelę.
Toliau pateikta infografika apibendrina FISH ir CGH skirtumus.
Santrauka – FISH vs CGH
FISH ir CGH yra du molekuliniai citogenetikos metodai, palengvinantys dominančių genų sekų aptikimą. FISH palengvina specifinės DNR sekos aptikimą chromosomoje, naudojant fluorescenciniu būdu pažymėtus zondus, o CGH palengvina genominės DNR pakitimų aptikimą. Taigi, tai yra pagrindinis FISH ir CGH skirtumas.
