Pagrindinis skirtumas – oligonukleotidas prieš polinukleotidą
Nukleotidai yra pagrindiniai struktūriniai vienetai, sintezuojantys sudėtingas polimerines DNR (dezoksiribozės nukleorūgšties) ir RNR (ribozės nukleorūgšties) formas. Nukleotidai yra organinės molekulės. Jie susideda iš trijų pagrindinių subvienetų: azoto bazės, pentozės cukraus (ribozės / dezoksiribozės) ir fosfatų grupės. Iš nukleotidų susintetinta DNR ir RNR gyvoje sistemoje veikia kaip esminės biomolekulės. Yra daug nukleotidų tipų, įskaitant oligonukleotidus ir polinukleotidus. Oligonukleotidai yra trumpi DNR ir RNR segmentai su vienu ar daugiau nukleotidų monomerų, o polinukleotidai yra biopolimerai su 13 ar daugiau nukleotidų monomerų. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp oligonukleotidų ir polinukleotidų.
Kas yra oligonukleotidas?
Trumpi DNR ir RNR molekulių segmentai yra žinomi kaip oligonukleotidai. Jie plačiai naudojami teismo medicinos, genetikos ir tyrimų srityse. Oligonukleotidai gali būti gaminami kietosios fazės cheminės sintezės būdu, atliekamu laboratorijoje. Jie gaminami kaip vienos grandinės molekulės, kurių seka yra nurodyta konkrečiai funkcijai ir yra svarbus aspektas PGR (polimerazės grandininės reakcijos), DNR mikrogardelių, Southern blot technikos, FISH (fluorescencinės in situ hibridizacijos), sintezės dirbtiniai genai, gamina DNR/RNR bibliotekas ir veikia kaip molekuliniai zondai.
01 pav.: Oligonukleotidas
Oligonukleotidai natūraliai atsiranda kaip mikroRNR, mažos RNR molekulės, reguliuojančios genų ekspresiją. Oligonukleotidų taip pat gali būti dėl didesnių nukleorūgščių katabolizmo. Visą molekulę apibūdina ir išvysto nukleotidų liekanų seka. Oligonukleotidai, sudaryti iš DNR fragmentų, naudojami PGR metu, o tai procesas, kurio metu nedidelis DNR kiekis gali būti amplifikuojamas į milijonus kopijų. Čia oligonukleotidai veikia kaip pradmenys, padedantys veikti DNR polimerazei. Chemiškai arba natūraliai modifikuotas nukleozidas, žinomas kaip fosforamiditas, veikia kaip pagrindinis komponentas oligonukleotidų sintezės metu. Oligonukleotidų grandinės sintezė vyksta nuo 3' galo iki 5' galo cikliniame kelyje, vadinamame sintetiniu ciklu. Pasibaigus vienam sintetiniam ciklui, vienas nukleotidas pridedamas prie augančios grandinės.
Kas yra polinukleotidas?
Polinukleotido molekulė susideda iš 13 ar daugiau nukleotidų monomerų ir yra vadinama biopolimeru. Monomerai yra kovalentiškai sujungti su nukleotidų grandine. DNR ir RNR yra polinukleotidų pavyzdžiai. Paprasčiausias polinukleotidas gyvoje sistemoje yra RNR (ribonukleino rūgštis), kurioje yra pentozės cukraus ribozė. RNR susideda iš vienos grandinės polinukleotido. Molekulė sudaryta iš keturių azoto bazių: adenino, guanino, citozino ir uracilo. RNR yra įvairių tipų: mRNR (pasiuntimo RNR), rRNR (ribosomų RNR), tRNR (pernešimo RNR).
Deoksiribozės nukleorūgštis (DNR) yra dar vienas polinukleotidas, susidedantis iš pentozės cukraus dezoksiribozės. Azoto bazės yra adeninas, guaninas, timinas ir citozinas, sudarytos iš dviejų spirališkai išdėstytų polinukleotidų grandinių. Adenino pora su timinu ir guanino pora su citozinu. Tai vadinama papildomu baziniu poravimu.
02 pav.: polinukleotidas
Polinukleotidai, tiek DNR, tiek RNR, natūraliai atsiranda gyvuose organizmuose ir naudojami tiek biologiniams, tiek biocheminiams eksperimentams. Polinukleotidai naudojami PGR ir DNR sekos nustatymui. Juos galima sintetinti dirbtinai naudojant oligonukleotidus. Norint susintetinti ir išplėsti polinukleotido grandinę, pridedami nauji nukleotidai, o grandinė pratęsiama dalyvaujant polimerazės fermentams.
Kokie yra oligonukleotidų ir polinukleotidų panašumai?
- Oligonukleotidai ir polinukleotidai yra DNR ir RNR monomerai
- Abu naudojami daugelyje genetinių metodų, įskaitant FISH ir PGR.
Kuo skiriasi oligonukleotidai ir polinukleotidai?
Oligonukleotidas prieš polinukleotidą |
|
| Oligonukleotidas yra DNR arba RNR fragmentas, sudarytas iš vieno ar daugiau nukleotidų monomerų. | Polinukleotidas yra biopolimeras, sudarytas iš 13 ar daugiau nukleotidų monomerų. |
| Dydis | |
| Oligonukleotidas yra trumpesnis už polinukleotidą. | Polinukleotidas yra ilgesnis už oligonukleotidą. |
| Funkcija | |
| Oligonukleotidai naudojami genetiniuose metoduose, pvz., FISH. PGR, DNR mikro matrica. | Polinukleotidai naudojami FISH, PGR, DNR sekos nustatymui ir kt. |
Santrauka – oligonukleotidai prieš polinukleotidus
Nukleotidai yra svarbios biomolekulės, kurios dalyvauja pagrindinėse medžiagų apykaitos funkcijose gyvose sistemose. Jie yra ir DNR, ir RNR monomerai. Nukleotidai yra organinės molekulės ir susideda iš trijų pagrindinių subvienetų: azoto bazės, pentozės cukraus ir fosfatų grupės. Oligonukleotidai ir polinukleotidai yra du svarbūs nukleotidų tipai. Abi molekulės naudojamos įvairiuose genetiniuose metoduose, įskaitant FISH ir PGR. Oligonukleotidai susideda iš vieno ar daugiau nukleotidų monomerų, o polinukleotidus sudaro 13 ar daugiau nukleotidų monomerų. Oligonukleotidai yra trumpesni už polinukleotidus. Tai skirtumas tarp oligonukleotidų ir polinukleotidų.
Atsisiųsti oligonukleotidų ir polinukleotidų PDF versiją
Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungus, kaip nurodyta citatos pastaboje. Atsisiųskite PDF versiją čia. Skirtumas tarp oligonukleotido ir polinukleotido
