Pagrindinis skirtumas tarp izochizomerų ir izokaudomerių yra tas, kad izochizomerai atpažįsta ir atskiria tą pačią restrikcijos arba atpažinimo vietą, o izokaudomerai atpažįsta šiek tiek skirtingas restrikcijos vietas ir suskaldo toje pačioje vietoje.
Restrikcijos fermentai arba restrikcijos endonukleazės yra nukleazių tipas, skaidantis dvigrandę DNR. Jie gali atpažinti konkrečias sekas, vadinamas restrikcijos vietomis, kurios yra palindrominės kilmės. Bakterijos gamina restrikcijos fermentus prieš svetimus patogenus, ypač prieš virusus. Tai gynybos mechanizmo forma, kurią parodo bakterijos. Priklausomai nuo fermento struktūros ir pjūvių pobūdžio, yra trijų tipų restrikcijos fermentai: I tipo restrikcijos fermentai, II tipo restrikcijos fermentai ir II tipo restrikcijos fermentai. Be to, priklausomai nuo biocheminio aktyvumo ir išskyrimo š altinio, yra trijų tipų restrikcijos fermentai: izochizomerai, neoschizomerai ir izokaudomerai.
Kas yra izoschizomeriai?
Izoschizomerai yra restrikcijos fermento tipas, gaunamas iš skirtingų š altinių, tačiau atpažįsta ir atskiria tą pačią restrikcijos vietą DNR. Todėl du izoschizomeriai turi tą pačią atpažinimo vietą. Jie skyla toje pačioje vietoje, todėl yra būdingi tai pačiai atpažinimo sekai. Pavyzdžiui, restrikcijos fermentai SphI ir BbuI yra du izochizomerai, kurie atpažįsta ir suskaldo CGTAC/G.
01 pav.: Restrikcijos fermentas
Kita izochizomerų pora yra HpaII ir MspI. Jie abu atpažįsta 5′-CCGG-3′ seką ir suskaido DNR. Be to, Bsp EI ir Acc III taip pat yra izoschizomerai, kurie yra atitinkamai iš Bacillus rūšies ir Acinetobacter calcoaceticus. Izoschizomerus galima išskirti iš skirtingų bakterijų. Kadangi jie kilę iš skirtingų bakterijų, jų apribojimo sąlygos gali skirtis.
Kas yra izokaudomerai?
Izokaudomerai yra restrikcijos fermento tipas, kuris atpažįsta šiek tiek skirtingas sekas, bet suskaldo toje pačioje vietoje, kad susidarytų tie patys galai. Isocaudomers taip pat kilę iš skirtingų bakterijų. Sau3a ir BamHI yra izokaudomerių pora. Po tos pačios vietos skilimo jie gamina 5'-GATC-3' lipnų galą. Kita izokaudomerių pora yra NcoI iš Nocardia corallina ir PagI iš Pseudomonas alcaligenes. Šie du fermentai taip pat jungiasi skirtingose atpažinimo sekose, bet pjauna toje pačioje vietoje ir gamina tuos pačius lipnius galus. Todėl gaminami pjovimo galai yra suderinami vienas su kitu ir gali būti sujungti vienas su kitu. XhoI, PspXI ir SalI taip pat yra izokaudomerai.
Kokie yra izochizomerų ir izokaudomerių panašumai?
- Izoschizomerai ir izokaudomerai yra dviejų tipų restrikcijos fermentai.
- Du izoschizomerai turi tą pačią virškinimo vietą, panašiai kaip du izokaudomerai, kurių virškinimo vieta yra ta pati.
- Jie yra prokariotinės kilmės.
- Abu turi apribojimų atpažinimo ir virškinimo vietą.
- Jie gamina galus, kurie yra suderinami vienas su kitu.
- Be to, šie fermentai yra naudingi rekombinantinės DNR technologijos įrankiai.
Kuo skiriasi izochizomerai ir izokaudomerai?
Izoschizomerai yra restrikcijos fermentai, atpažįstantys tą pačią DNR seką ir suskaldantys toje pačioje restrikcijos vietoje, o izokaudomerai yra restrikcijos fermentai, atpažįstantys šiek tiek skirtingas DNR sekas, bet išpjaunantys toje pačioje vietoje, gaminantys tuos pačius lipnius galus. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp izoschizomerų ir izokaudomerių.
Toliau pateiktoje infografijoje pateikiami skirtumai tarp izochizomerų ir izokaudomerių.
Santrauka – Isoschizomers vs Isocaudomers
Izoschizomerai yra restrikcijos fermentai, atpažįstantys tą pačią DNR seką ir suskaldantys toje pačioje vietoje. Kita vertus, izokaudomerai yra restrikcijos fermentai, kurie atpažįsta šiek tiek skirtingas sekas ir suskaldo toje pačioje vietoje, sudarydami tuos pačius galus. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp izoschizomerų ir izokaudomerių. SphI, BbuI, HpaII ir MspI yra keli izochizomerų pavyzdžiai, o Sau3a ir BamHI yra du izokaudomerų pavyzdžiai. Tiek izoschizomerus, tiek izokaudomerus natūraliai gamina bakterijos.
