Pagrindinis skirtumas tarp Shine Dalgarno ir Kozak sekų yra tas, kad Shine Dalgarno seka yra ribosomų surišimo vieta bakterijų ir archeologinėje pasiuntinio RNR, o Kozak seka yra b altymų transliacijos inicijavimo vieta daugumoje eukariotų pasiuntinių RNR.
Shine Dalgarno ir Kozak sekos yra dvi konsensuso sekos, kurios labai svarbios vertimo inicijavimui. Molekulinėje biologijoje vertimas yra procesas, kurio metu citoplazmoje esančios ribosomos sintetina b altymus po transkripcijos proceso. Transliacijos metu ribosomoje dekoduojama mRNR (RNR pasiuntinys), kad susidarytų specifinė aminorūgščių grandinė už branduolio ribų. Paprastai ribosoma indukuoja dekodavimo procesą, palengvindama komplementarių tRNR antikodonų sekų prisijungimą prie mRNR kodonų. Vertimas vyksta trimis etapais: inicijavimas, pailgėjimas ir užbaigimas.
Kas yra Shine Dalgarno seka?
Shine Dalgarno seka yra ribosomų surišimo vieta bakterijų ir archeologinėje pasiuntinio RNR. Paprastai jis yra maždaug 8 bazėse prieš srovę nuo pradžios kodono AUG. Ši RNR seka padeda įdarbinti ribosomas į pasiuntinio RNR, suderindama ribosomą su mRNR pradžios kodonu. Taigi, jis inicijuoja b altymų sintezę. Kartą po įdarbinimo tRNR gali pridėti aminorūgščių seka, kaip diktuoja mRNR kodonai. Ši ypatinga seka paplitusi bakterijose, bet retesnė archėjose. Be to, jo taip pat yra chloroplastų ir mitochondrijų transkriptuose. „Shine Dalgarno“seką pirmą kartą pasiūlė Australijos mokslininkai Johnas Shine'as ir Lynn Dalgarno. Šešių bazių konsensuso seka yra AGGAGG. Pavyzdžiui, Escherichia coli seka yra AGGAGGU.
01 pav.: Šviesinkite Dalgarno seką
Iniciacijos vietos (AUG) pasirinkimas priklauso nuo sąveikos tarp ribosomos 30S subvieneto ir mRNR šablono. 30S subvieneto 16srRNR komponento pirimidino turtinga sritis jungiasi prie purino turtingos srities, žinomos kaip Shine Dalgarno seka priešais mRNR AUG iniciacijos kodoną. Be to, formuojant iniciacijos kompleksą, šios komplementarios nukleotidų sekos susijungia ir sudaro dvigrandę RNR struktūrą. Tai palengvina mRNR prisijungimą prie ribosomos tokiu būdu, kad iniciacijos kodonas yra ribosomos P vietoje.
Kas yra Kozako seka?
Kozak seka yra daugumos eukariotų mRNR b altymų transliacijos inicijavimo vieta. Ši seka dar vadinama Kozako konsensuso seka. Kozako seka yra optimali seka transliacijai eukariotuose pradėti. Ši seka yra neatskiriama b altymų reguliavimo dalis. Tai taip pat labai svarbu bendrai ląstelių sveikatai. Tai padeda koreguoti b altymų transliaciją iš genetinių pranešimų, nes tarpininkauja ribosomų surinkimui ir vertimo inicijavimui.
02 pav.: Kozako seka
Ši seka buvo pavadinta ją atradusios mokslininkės Marilyn Kozak vardu. Ji tai atrado išsamiai analizuodama DNR genomines sekas. Kozako seka yra 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’. Didžiosios raidės žymi konservuotus pagrindus, o mažosios – bendrus kintamuosius pagrindus. R žymi puriną (adeniną arba guaniną), kuris visada yra šioje vietoje.
Kokie yra Shine Dalgarno ir Kozak sekos panašumai?
- Shine Dalgarno ir Kozak sekos yra dvi konsensuso sekos, kurios labai svarbios inicijuojant vertimą.
- Abi yra RNR sekos.
- Mažesnis ribosomos subvienetas jungiasi prie abiejų sekų.
- Abi sekos tarpininkauja tinkamam ribosomų surinkimui ir vertimo inicijavimui.
- Jie yra neatsiejami b altymų reguliavimo ir bendros ląstelių sveikatos aspektai.
Kuo skiriasi Shine Dalgarno ir Kozak Sequence?
Shine Dalgarno seka yra ribosomų surišimo vieta, randama bakterijų ir archeologinėje pasiuntinio RNR, o Kozako seka yra b altymų transliacijos inicijavimo vieta, randama daugumoje eukariotų pasiuntinių RNR. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp Shine Dalgarno ir Kozak sekos. Be to, Shine Dalgarno seka yra 5'AGGAGGU3', o Kozak seka yra 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
Toliau pateiktoje infografikoje pateikiami Shine Dalgarno ir Kozak sekų skirtumai lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – Shine Dalgarno vs Kozak seka
Shine Dalgarno ir Kozak sekos yra dvi konsensuso RNR sekos, kurios labai svarbios ribosomų surinkimui ir transliacijos inicijavimui. Shine Dalgarno seka yra ribosomų surišimo vieta bakterijų ir archeologinėje pasiuntinio RNR, o Kozako seka yra b altymų transliacijos inicijavimo vieta daugumoje eukariotų pasiuntinių RNR. Taigi, tai apibendrina skirtumą tarp Shine Dalgarno ir Kozak sekų.
