Pagrindinis skirtumas tarp cis ir trans sujungimo yra tas, kad cis sujungimas yra intramolekulinis mechanizmas, pašalinantis intronus ir sujungiantis egzonus, esančius tame pačiame RNR transkripte, o transsplaisavimas yra tarpmolekulinis mechanizmas, pašalinantis intronus arba outronus ir prisijungia prie egzonų, kurie nėra tame pačiame RNR nuoraše.
RNR sujungimas yra RNR apdorojimo prieš b altymų sintezę forma. Šiame procese naujai pagamintas išankstinio pasiuntinio RNR nuorašas transformuojamas į subrendusią pasiuntinio RNR. Brandi pasiuntinio RNR padeda gaminti b altymo molekulę. RNR sujungimo metu intronai (nekoduojantys regionai) pašalinami, o egzonai (koduojantys regionai) sujungiami, kad susidarytų brandi mRNR. Cis ir trans sujungimas yra dviejų tipų RNR sujungimo mechanizmai.
Kas yra Cis sujungimas?
Cis sujungimas yra intramolekulinis mechanizmas, kuris pašalina intronus ir sujungia egzonus, esančius tame pačiame RNR transkripte. Normalus cis sujungimas apdoroja vieną RNR molekulę. Cis sujungimas yra tipiškas pre-mRNR sujungimo procesas, kurį atlieka spliceosomos. Introne donoro vieta (5' introno galas), šakos vieta (netoli 3' introno galo) ir akceptoriaus vieta (3' introno galas) yra labai svarbios sujungimui. Sujungimo donoro vieta apima nekintamą seką GU 5' introno gale. Sujungimo akceptoriaus vieta 3' introno gale turi nekintamą AG seką. Prieš srovę nuo AG sekos yra sritis, vadinama pirimidino sritimi (polipirimidino traktas). Toliau prieš polipirimidino traktą yra šakos taškas, apimantis adenozino nukleotidą. Šis nukleotidas dalyvauja formuojant lariatą.
01 pav.: Cis ir Trans sujungimas
Pagrindinės junginės yra U1, U2, U4, U5 ir U6. Tarp jų U1 ir U2 yra labai svarbūs. Atliekant cis sujungimą, U1 jungiasi prie 5' sujungimo vietos, o U2 prisijungia prie šakos taško, esančio šalia 3' sujungimo vietos. U5/U4/U6 suriša egzonus 5’ vietoje, o U6 – su U2. Vėliau pasirodys U1. U5 pereina iš egzono į introną, o U6 jungiasi 5 'sujungimo vietoje. Be to, išleistas ir U4. U6/U2 katalizuoja peresterifikaciją, todėl 5' introno galas susijungia su A nukleotidu ant introno. Tai sukelia lariatų susidarymą. Formuojantis lariatui, U5 suriša egzoną 3' susiliejimo vietoje, o 5' vieta yra suskaidoma. Paskutinėje sujungimo fazėje U2 / U5 / U6 lieka surišti su lariatu, o 3 ' vieta yra suskaidoma. Be to, šioje fazėje egzonai surišami naudojant ATP hidrolizę.
Kas yra transsplicavimas?
Transinis sujungimas yra tarpmolekulinis mechanizmas, kuris pašalina intronus arba outronus ir sujungia egzonus, kurie nėra tame pačiame RNR transkripte. Atliekant trans-splaisingumą, pre-mRNR molekulėje nėra 5' sujungimo vietos, prie kurios galėtų prisijungti U1 b altymas. Vietoj to, apribota sujungimo lyderio (SL) RNR yra trans-splice į seką outrone.
02 pav.: Transsplicing
Outron yra pre-mRNR sritis tarp 5' dangtelio ir trans-susijungimo vietos. Tačiau U2 b altymas paprastai jungiasi prie 3' sujungimo vietos. Pašalinus outroną, sujungimo lyderio (SL) egzonas sujungiamas su pirmuoju pre-mRNR egzonu. Be to, trans-splicing yra mechanizmas, stebimas tam tikruose mikroorganizmuose, tokiuose kaip Kinetoplastae klasės protistai, norint išreikšti genus.
Kokie yra Cis ir Trans sujungimo panašumai?
- Cis ir trans sujungimas yra dviejų tipų RNR sujungimo mechanizmai.
- Abu mechanizmuose intronai pašalinami.
- Be to, abiejuose mechanizmuose egzonai susijungia, kad susidarytų brandi mRNR.
- Abu mechanizmai randami eukariotuose.
- Šių mechanizmų prokariotuose nėra.
Kuo skiriasi Cis ir Trans sujungimas?
Cis sujungimas yra intramolekulinis mechanizmas, kuris pašalina intronus ir sujungia egzonus, esančius tame pačiame RNR transkripte, o transsplaisavimas yra tarpmolekulinis mechanizmas, pašalinantis intronus arba outronus ir sujungiantis egzonus, kurie nėra toje pačioje RNR. nuorašas. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp cis ir trans sujungimo. Be to, cis splaisingo metu intronai pašalinami, kad susidarytų brandi mRNR. Kita vertus, trans sujungimo metu intronai arba outronai pašalinami, kad susidarytų brandi mRNR.
Toliau pateiktoje infografijoje lentelės pavidalu pateikiami skirtumai tarp cis ir trans sujungimo, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – Cis vs Trans sujungimas
RNR sujungimas yra RNR apdorojimo forma prieš b altymų sintezės procesą. Cis ir trans sujungimas yra dviejų tipų RNR sujungimo mechanizmai, randami eukariotuose. Cis sujungimas yra intramolekulinis mechanizmas, kuris pašalina intronus ir sujungia egzonus, esančius tame pačiame RNR transkripte, o trans-splicing yra tarpmolekulinis mechanizmas, kuris pašalina intronus arba outronus ir sujungia egzonus, kurie nėra tame pačiame RNR transkripte. Taigi, tai baigia diskusiją apie skirtumą tarp cis ir trans sujungimo.
