Pagrindinis skirtumas tarp pradmens ir promotoriaus yra tas, kad pradmuo yra komerciškai susintetinta trumpa DNR seka, kuri naudojama PGR, siekiant amplifikuoti tikslinę DNR seką, o promotorius yra specifinė DNR seka, kuri suteikia saugią pradinę RNR surišimo vietą. polimerazė ir transkripcijos faktoriai, kad būtų pradėta transkripcija.
Primer ir promotorius yra dviejų tipų DNR sekos. Pradmenys yra mažas DNR fragmentas, reikalingas polimerazės grandininei reakcijai (PGR). Jis turi trumpas nukleotidų sekas, papildančias besiribojantį DNR grandinės galą. Yra dviejų tipų pradmenys ir jie veikia kaip naujų DNR grandžių sintezės pradžios taškai. Priešingai, promotorius yra specifinė DNR seka, esanti prieš geno transkripcijos pradžios vietą. Jis tiesiogiai sąveikauja su transkripcijos mechanizmo komponentais, tokiais kaip RNR polimerazė ir transkripcijos faktoriai, kad galėtų kontroliuoti DNR transkripciją. Todėl RNR polimerazė ir kiti transkripcijos faktoriai prisijungia prie promotoriaus sekos ir inicijuoja transkripciją.
Kas yra gruntas?
Pradmenys yra trumpos DNR sekos, sukurtos tikslinių DNR sekų amplifikacijai. Struktūriškai jie turi trumpas nukleotidų sekas, papildančias besiribojančius DNR dvigubų grandžių galus. Paprastai jie yra apie 20 nukleotidų ilgio. PGR metu Taq polimerazė katalizuoja nukleotidų pridėjimą į jau egzistuojančią nukleotidų seką. Taigi pradmenys yra naujų gijų sintezės pradžios taškai. Taq polimerazė veikia tik nuo 5 iki 3 colių kryptimi. Vadinasi, DNR sintezė taip pat vyksta ta pačia 5’-3’ kryptimi. Kadangi DNR yra dvigrandė, PGR reikalingi dviejų tipų pradmenys. Jie žinomi kaip pirminis pradmuo ir atvirkštinis pradmenys, pagrįsti pradmens pailgėjimo kryptimi DNR sintezės metu.
01 pav.: Gruntai
Pirmyn pradmenys susilieja su antisensine DNR grandine ir inicijuoja + geno grandinės sintezę 5’–3’ kryptimi. Ji turi trumpą nukleotidų seką, kuri yra komplementari su antisensinės grandinės 3' besiribojančiu galu. Atvirkštinis pradmuo susilieja su sensorine grandine ir inicijuoja papildomos koduojančios grandinės grandinės sintezę, kuri yra - geno grandinė 5–3 kryptimi. Taigi atvirkštinis pradmuo yra sukurtas papildantis koduojančios grandinės 3' galą. Tiek atvirkštiniai, tiek priekiniai pradmenys yra svarbūs gaminant nuo milijonų iki milijardų konkrečių DNR sričių, kurioms taikoma arba kuri yra suinteresuota, kopijų.
Kas yra reklamuotojas?
Promotorius yra DNR seka, esanti prieš geno transkripcijos pradžios vietą arba 5′ gale. Jis suteikia surišimo vietą RNR polimerazei ir tam tikriems reguliavimo elementams, kad inicijuotų geno transkripciją. Tai reguliavimo seka, reikalinga genui įjungti arba išjungti. Promotoriuje yra specifinė nukleotidų seka. Jis gali turėti 100–1000 bazinių porų. Promoteris rodo transkripcijos kryptį. Be to, ji nurodo prasmę, kuri turėtų būti perrašyta.
02 pav.: Geno promotorius
Yra trijų tipų promotoriaus elementai: pagrindinis promotorius, proksimalinis promotorius ir distalinis promotorius. Pagrindinis promotorius yra minimali promotoriaus dalis, reikalinga transkripcijai inicijuoti. Jis yra arčiausiai pradžios kodono. TATA dėžutė yra konservuota sritis, randama daugelyje eukariotų šerdies promotorių. Jis randamas nuo 25 iki 35 bazių porų prieš transkripcijos pradžios vietą. Proksimalinis promotorius yra daugiau prieš pagrindinį promotorių. Paprastai jis yra 250 bazinių porų prieš starto kodoną ir jame yra pirminių reguliavimo elementų. Distalinis promotorius yra prieš proksimalinį promotorių ir jame yra papildomų reguliavimo elementų. Bakteriniai promotoriai savo promotoriuose turi du trumpos sekos elementus. TATAAT yra konsensuso seka, esanti -10 bakterijų promotoriaus, o TTGACA yra konsensuso seka -35. Jie žinomi kaip -10 elementas ir -35 elementas.
Kokie yra „Primer“ir „Promoter“panašumai?
- Pradmenys ir promotorius yra dviejų tipų DNR sekos.
- Jos susideda iš nukleotidų sekų.
- Ir pradmenys, ir promotorius yra svarbūs genų ekspresijai.
Kuo skiriasi gruntas ir reklamuotojas?
Primer yra trumpa nukleotidų seka, skirta tikslinės DNR amplifikacijai. Priešingai, promotorius yra specifinė reguliavimo DNR seka, randama prieš geno transkripcijos pradžios vietą. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp pradmenų ir promotoriaus. Pradmenų ilgis yra apie 20 bazinių porų, o promotorius gali turėti 100–1000 bazinių porų. Funkciškai pradmenys naudojami kaip pradinės sekos naujos grandinės sintezei, o promotoriai kontroliuoja genų transkripciją, suteikdami surišimo vietas RNR polimerazei ir kitiems transkripcijos faktoriams.
Be to, promotorius apibrėžiamas kaip transkripcijos kryptis ir nurodo geno jutimo grandinę. Struktūriškai pradmuo yra trumpa vienos grandinės DNR seka, o promotorius yra ilga dvigrandė DNR seka.
Toliau pateiktoje informacinėje lentelėje pateikiama daugiau palyginimų, susijusių su pradmenų ir promotoriaus skirtumais.
Santrauka – „Primer vs Promoter“
Pradmenys yra trumpos nukleotidų sekos, papildančios tikslinės DNR dvigubos grandinės greta esančius galus. PGR naudojami dviejų tipų pradmenys. Jie tarnauja kaip pradinės sekos naujų grandžių sintezei. Gruntai yra komerciškai suprojektuoti ir yra temperatūros stabilios sekos. Kita vertus, promotorius yra reguliavimo seka geno, esančio prieš transkripcijos inicijavimo vietą. Promotoriai kontroliuoja genų transkripciją. Jie suteikia RNR polimerazės ir transkripcijos faktorių surišimo vietas, kad inicijuotų transkripciją. Taigi, tai yra skirtumo tarp pradmenų ir promotoriaus santrauka.
