Pagrindinis skirtumas tarp PARP1 ir PARP2 yra tas, kad augalų ir gyvūnų PARP1 turi Zn piršto DNR surišimo motyvus, o augalo PARP2 – N-galo SAP DNR surišimo motyvus.
Poli ADP ribozės polimerazė (PARP) yra b altymų, kurie yra branduoliniai fermentai, šeima. PARP šeimoje yra 17 skirtingų PARP fermentų tipų. PARP1 ir PARP2 yra du fermentai, būtini normaliai DNR atkūrimo veiklai.
Kas yra PARP?
PARP (poli ADP ribozės polimerazė) yra b altymų šeima, dalyvaujanti daugelyje ląstelių procesų, tokių kaip DNR atstatymas, genomo stabilumas ir užprogramuota ląstelių mirtis. Jie katalizuoja procesą, vadinamą ADP-ribozilinimu. ADP-ribozilinimas reiškia ADP-ribozės vienetų pridėjimą iš nikotinamido adenino dinukleotido (NAD) į tikslinius substratus, siekiant atitaisyti DNR grandinės pertraukas.
PARP fermentai yra DNR surišantys b altymai. Juos aktyvuoja DNR molekulėse esantys įtrūkimai. Susijungę su DNR pertraukomis, jie hidrolizuoja NAD+ į nikotinamidą ir skatina ADP-ribozės polimerizaciją. Todėl PARP branduoliniai fermentai dalyvauja DNR atstatyme. Be to, poli-ADP-ribosilinimas veikia kaip potransliacinė modifikacija, kuri atlieka pagrindinį vaidmenį replikacijoje, transkripcijos reguliavime, telomerų palaikyme ir b altymų skaidyme. PARP fermentai taip pat dalyvauja palaikant genomo stabilumą, reguliuojant chromatino struktūrą, ląstelių proliferaciją ir apoptozę.
Kas yra PARP1?
PARP1 yra PARP b altymų šeimos narys. Tai pirmasis ir geriausiai apibūdinamas b altymas šioje šeimoje. Jis veikia kaip pirmasis atsakiklis, aptinkantis DNR pažeidimus ir palengvinantis taisymo mechanizmo pasirinkimą. Be to, PARP1 reguliuoja vienos grandinės DNR pažeidimų taisymą.
01 pav.: PARP1
Be to, kad taiso vienos grandinės DNR pertraukas, PARP1 reguliuoja replikacijos šakės progresavimą ir paleidimą iš naujo. Be to, jis skatina alternatyvų nehomologinį galinį sujungimą.
Kas yra PARP2?
PARP2 yra dar vienas PARP b altymų šeimos narys. Jis glaudžiai susijęs su PARP1 fermentu. PARP2 genas koduoja PARP2 b altymą žmonėms. PARP2 turi katalizinį domeną, bet neturi N galinės DNR surišimo domeno. PARP inhibitorių vaistai nuo vėžio gali slopinti PARP2, panašiai kaip PARP1.
02 pav.: PARP2
Augaluose, ypač Arabidopsis thaliana, PARP2 vaidina svarbų vaidmenį apsaugant atsaką į DNR pažeidimą ir bakterijų patogenezę nei PARP1.
Kokie yra PARP1 ir PARP2 panašumai?
- PARP1 ir PARP2 yra dviejų tipų branduoliniai fermentai.
- Jie naudoja NAD+ kaip substratą poli-ADP ribozilinimui katalizuoti.
- Abu yra aktyvuojami dėl DNR vienos grandinės pertraukų.
- Žinduolių PARP1 ir PARP2 yra branduolyje.
- Ir PARP1, ir PARP2 sąveikauja su chromatinu.
- Jie taiso DNR pažeidimus.
- Kai kurie PARP inhibitoriai priešvėžiniai vaistai, skirti PARP1, taip pat slopina PARP2.
Kuo skiriasi PARP1 ir PARP2?
PARP1 yra PARP b altymų šeimos narys, turintis katalizinį domeną ir N-galinį DNR surišimo domeną, o PARP2 yra PARP šeimos narys, kuriam trūksta N-galo DNR surišimo domeno. Pagrindinis skirtumas tarp PARP1 ir PARP2 yra tas, kad augalų ir gyvūnų PARP1 turi Zn piršto DNR surišimo motyvus, o augalo PARP2 – N-galo SAP DNR surišimo motyvus.
Toliau pateikta infografija apibendrina skirtumą tarp PARP1 ir PARP2.
Santrauka – PARP1 prieš PARP2
PARP yra branduoliniai fermentai, kurie jaučia DNR pažeidimus ir juos atkuria. PARP1 ir PARP2 yra du iš jų, kurie yra glaudžiai susiję. Abu fermentai turi katalizinį domeną. Tačiau PARP2 neturi N-galinio DNR surišimo domeno, kuris yra PARP1. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp PARP1 ir PARP2. Abiejų tipų fermentai naudoja NAD+ kaip substratą.