Pagrindinis skirtumas tarp RNR trukdžių ir antisensinio oligonukleotido yra tas, kad RNR trukdžiai yra metodas, apimantis sekai specifinį genų ekspresijos slopinimą dvigrandė RNR, o antisensinis oligonukleotidas metodas, apimantis sekai specifinį genų ekspresijos slopinimą vienos grandinės DNR oligonukleotidu.
Genų nutildymas arba slopinimas yra būdas reguliuoti genų ekspresiją biologinėje ląstelėje, siekiant užkirsti kelią konkretaus geno ekspresijai. Paprastai, kai genai nutildomi, jų ekspresija sumažėja. Priešingai, kai genai išmušami, jie visiškai ištrinami iš organizmo genomo; taigi, neturės išraiškos. Kartais genų nutildymas laikomas tuo pačiu genų nutildymu. Taip yra todėl, kad genų nutildymo metodai, tokie kaip RNRi, antisensinis oligonukleotidas ir CRISPR, naudojami genams nutildyti, sumažina genų ekspresiją mažiausiai 70%. RNR trukdžiai ir antisensiniai oligonukleotidai yra du svarbūs genų nutildymo būdai.
Kas yra RNR trukdžiai?
RNR trukdžiai (RNAi) yra biologinis procesas, kurio metu dvigrandės RNR molekulės atlieka sekai specifinį genų ekspresijos slopinimą. 2006 m. Andrew Fire ir Craigas C. Mello gavo Nobelio premiją medicinos srityje už išskirtinį darbą, susijusį su RNR trukdymu nematodo kirminui Caenorhabditis elegans. Šį novatorišką RNR trukdžių tyrimą jie pirmą kartą paskelbė 1998 m. Paprastai RNRi kelias randamas daugelyje eukariotinių organizmų, įskaitant gyvūnus.
01 pav.: RNR trukdžiai
RNRi kelyje dalyvauja dvi centrinės molekulės – mikroRNR (miRNR) ir mažų trukdžių RNR (siRNR). Fermentas, vadinamas Dicer, sukelia šį kelią. Dicer suskaido ilgą dvigrandę RNR į trumpus dvigrandžius fragmentus (21 nukleotido siRNR). Tada kiekviena siRNR išvyniojama į dvi vienos grandinės RNR, žinomas kaip keleivinė ir kreipiamoji grandis. Keleivių grandinė suardoma, o kreipiamoji grandinė įtraukiama į RNR sukeltą tylėjimo kompleksą (RISC). RISC kreipiamųjų grandinių poras su komplementaria mRNR, kuri suaktyvina Argonaute (Ago2), RISC komplekso katalizinį komponentą. Vėliau Argonaute suskaido mRNR molekulę. Skirtingai nuo siRNR, mikroRNR (miRNR) nukreipta į 3 'netransliuotą mRNR sritį, kur jos jungiasi netobulu papildomumu. Tai blokuoja mRNR prieigą prie ribosomų vertimui.
Kas yra antisensinis oligonukleotidas?
Antisense oligonukleotidas yra metodas, kuris apima sekai specifinį genų ekspresijos slopinimą vienos grandinės DNR oligonukleotidu. Šis metodas taip pat vadinamas antisense terapija Tai terapijos forma, kai naudojami antisensiniai oligonukleotidai (ASO), nukreipti į pasiuntinio RNR (mRNR). Antisensiniai oligonukleotidai pakeičia mRNR ekspresiją, naudodami įvairius mechanizmus, tokius kaip ribonukleazės H sąlygotas pre-mRNR skilimas, tiesioginis sterinis blokavimas ir egzonų turinio moduliavimas per sujungimo vietą su pre-mRNR.
02 pav.: Antisensinis oligonukleotidas
JAV ir Europos Sąjunga patvirtino keletą antisensinių oligonukleotidų ligų gydymui. Be to, antisensiniai oligonukleotidai jau buvo patvirtinti kaip daugelio ligų gydymas, įskaitant Batteno ligą, citomegalovirusinį retinitą, Diušeno raumenų distrofiją, šeiminę chilomikronemijos sindromą, šeiminę hipercholesterolemiją, paveldimą transtiretino sukeliamą amiloidozę ir stuburo raumenų atrofiją.
Kokie yra RNR trukdžių ir antisensinio oligonukleotido panašumai?
- RNR trukdžiai ir antisensinis oligonukleotidas yra du svarbūs genų nutildymo būdai.
- Abu metodai nukreipti į mRNR molekules.
- Tai yra konkrečios sekos metodai.
- Abu metodai naudojami kaip daugelio ligų gydymo būdai.
- Jie abu slopina genų ekspresiją.
Kuo skiriasi RNR trukdžiai ir antisensinis oligonukleotidas?
RNR trukdžiai yra metodas, apimantis sekai specifinį geno ekspresijos slopinimą dvigrandė RNR, o antisensinis oligonukleotidas yra metodas, apimantis sekai specifinį geno ekspresijos slopinimą vienos grandinės DNR oligonukleotidu. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp RNR trukdžių ir antisensinio oligonukleotido.
Toliau pateiktoje infografikoje pateikiami skirtumai tarp RNR trukdžių ir antisensinio oligonukleotido lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – RNR trukdžiai prieš priešprasminį oligonukleotidą
Genų slopinimo metodai sumažina ląstelių genų ekspresiją. RNR trukdžiai ir antisensinis oligonukleotidas yra du svarbūs genų nutildymo metodai. RNR trukdžiai yra metodas, apimantis sekai specifinį geno ekspresijos slopinimą dvigrande RNR, o antisensinis oligonukleotidas yra metodas, apimantis sekai specifinį geno ekspresijos slopinimą vienos grandinės DNR oligonukleotidu. Taigi čia apibendrinamas skirtumas tarp RNR trukdžių ir antisensinio oligonukleotido.
