Pagrindinis skirtumas tarp jungties ir adapterio yra tas, kad jungiklis neturi vientisų galų, o adapteris turi vieną rišlų galą.
DNR ligavimas yra dviejų DNR molekulių sujungimo procesas, suformuojant fosfodiesterio ryšius. Fermentas, vadinamas DNR ligaze, katalizuoja šią reakciją. Tai vienas iš svarbiausių žingsnių šiuolaikinėse molekulinės biologijos srityse, tokiose kaip rekombinantinės DNR technologija ir DNR klonavimas. Ligavimo efektyvumas priklauso nuo jungiamų DNR molekulių galų. Yra dviejų tipų DNR galai: lipnūs galai ir buki galai. Perrišimo efektyvumas yra didesnis, kai galai yra lipnūs, nei su bukais. Jei tikslinės DNR molekulės turi bukus galus, bus naudingos molekulės, vadinamos adapteriais arba jungikliais. Adapteriai ir jungikliai yra chemiškai susintetintos oligonukleotidų molekulės, kurios padeda susieti DNR. Jie taip pat turi vidines apribojimų svetaines. Adapterio galas yra lipnus ir vienas bukas, o jungiklis turi du bukus galus.
Kas yra Linker?
Linker yra chemiškai susintetinta oligonukleotidų seka, kuri yra dvigrandė. Linkeris turi du bukus galus. Linkeris naudojamas surišti DNR molekules, kurių galai yra buki, su vektoriais. Jame yra viena ar daugiau vidinių apribojimų svetainių. Šios restrikcijos vietos veikia kaip restrikcijos fermentų atpažinimo vietos.
01 pav.: Linker
Po surišimo DNR vėl apribojama restrikcijos fermentais, kad susidarytų rišlūs galai. EcoRI jungikliai ir sal-I jungikliai yra dažniausiai naudojami jungikliai.
Kas yra adapteris?
Adapteris yra dvigrandė oligonukleotidų seka, naudojama sujungti dvi DNR molekules. Tai trumpa seka, kurios vienas bukas galas ir vienas lipnus arba vientisas galas. Todėl viename jos gale yra vienos grandinės uodega, kuri padidina DNR surišimo efektyvumą.
02 pav.: DNR surišimas naudojant adapterį
Be to, adapteryje yra vidinių apribojimų svetainių. Todėl po ligavimo DNR gali būti apribota atitinkamais restrikcijos fermentais, kad būtų sukurtas naujas išsikišęs galas. Vienas adapterių trūkumas yra tas, kad du adapteriai gali sudaryti reguliatorius, suporuodami bazę su savimi. To galima išvengti apdorojant juos fermentu, vadinamu šarmine fosfataze.
Kokie yra Linker ir Adaptor panašumai?
- Tiek jungiklis, tiek adapteris yra dvigrandės trumpos oligonukleotidų sekos.
- Juose yra vidinių apribojimų svetainių.
- Be to, tai yra chemiškai susintetintos DNR molekulės ir yra sintetinės molekulės.
- Jie gali susieti dvi DNR molekules.
- Sujungus linkerius ir adapterius, DNR vėl apribojama restrikcijos fermentais, kad susidarytų lipnūs galai.
Kuo skiriasi Linker ir Adaptor?
Sąsaja yra chemiškai susintetintas trumpas oligonukleotidų dupleksas su dviem bukais galais. Adapteris yra chemiškai susintetintas trumpų oligonukleotidų dupleksas, kurio vienas lipnus galas ir vienas bukas galas. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp linkerio ir adapterio. Be to, adapteriai gali sudaryti dimerus, o jungikliai nesudaro dimerų. Taigi, tai dar vienas reikšmingas skirtumas tarp sąsajos ir adapterio.
Toliau pateikiama jungties ir adapterio skirtumų santrauka lentelės pavidalu.
Santrauka – Linker vs Adaptor
Linkeris ir adapteris yra dviejų tipų chemiškai susintetinti oligonukleotidai, kurie yra naudingi perrišant bukojo galo DNR. Linker turi du bukus galus, o adapteris turi vieną buką ir vieną vientisą galą. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp jungties ir adapterio. Tai dvigrandės molekulės, turinčios vidines restrikcijos vietas. Jie plačiai naudojami rekombinantinėje DNR technologijoje ir DNR klonavime.
