Pagrindinis skirtumas tarp ORF ir egzono yra tas, kad ORF arba atviras skaitymo rėmelis yra DNR sekos atkarpa, kuri prasideda transliacijos pradžios vieta (pradžios kodonu) ir baigiasi vertimo pabaigos vieta (stop kodonu), o egzonas yra nukleotidų seka geno, koduojančio aminorūgštis.
Atviras skaitymo rėmelis yra skaitymo rėmelio dalis. Skaitymo rėmelius skaito ribosomos, kad susidarytų b altymai. ORF yra nuolatinis kodonų ruožas, kuris suteikia visiškai funkcionuojantį b altymą. Jis prasideda pradžios kodonu ir baigiasi stop kodonu. ORF viduje nėra stopkodono, nutraukiančio kodavimo seką. Vertimas prasideda pradžios kodonu ir baigiasi stop kodonu. Egzonas yra geno nukleotidų seka. Jis koduoja b altymų aminorūgštis. Todėl egzonai yra koduojančios geno sritys.
Kas yra ORF?
Atviras skaitymo rėmelis arba ORF yra nuolatinis nukleotidų sekos ruožas, kuris prasideda pradžios kodonu ir baigiasi pabaigos kodonu. Paprastais žodžiais tariant, ORF reiškia nukleotidų sekos sritį, esančią tarp pradžios ir pabaigos kodonų. Tarp jų nėra sustabdymo kodono, nutraukiančio ORF. Nukleotidų seka tarp pradžios ir pabaigos kodono koduoja aminorūgštis. Paprastai pradžios kodonas yra ATG, o stabdymo kodonai yra TAG, TAA ir TGA. ORF suteikia funkcinį b altymą, kai transkribuojamas ir verčiamas. Todėl ORF apima pradžios kodoną, kelis kodonus vidurinėje srityje ir stop kodoną. Įdomu tai, kad ORF ilgis gali būti padalintas iš trijų.
01 pav.: ORF
Prokariotuose, kadangi nėra intronų, ORF yra koduojanti geno sritis, kuri transkribuoja tiesiogiai į mRNR. Kadangi eukariotuose yra intronų, ORF yra kodono seka, kuri susidaro po apdorojimo arba RNR sujungimo. ORF yra įrodymas, padedantis nuspėti geną, nes gali būti, kad ilgi ORF yra geno dalis.
Kas yra egzonas?
Egzonai yra koduojančios genų nukleotidų sekos, kurios virsta b altymais. Jie yra abiejose introno pusėse. Pašalinus nekoduojančias sekas iš išankstinės mRNR, subrendusi mRNR molekulė susideda tik iš egzonų sekų. Tada galutinės RNR molekulės (brendusios mRNR) nukleotidų seka paverčiama konkretaus b altymo aminorūgščių seka.
02 pav.: egzonai
Beveik visi genai turi pradinę nukleotidų seką, kuri ją išskiria kaip geną nuo pagrindinės DNR arba RNR grandinės, kuri yra žinoma kaip atvirasis skaitymo rėmas (ORF. Kai kuriuose genuose du ORF žymi visą geną ir egzonus). yra koduojančioje sekoje. Nors atrodo, kad egzonai visada išreiškiami genuose, yra atvejų, kai intronų sekos įsikiša į egzoną ir sukelia mutacijas, ir šis procesas vadinamas egzonizacija.
Kokie yra ORF ir Exon panašumai?
- Ir ORF, ir egzonas yra nukleotidų sekos.
- Ilgas ORF ir egzonai yra geno dalys.
- Abu turi kodavimo sekas.
Kuo skiriasi ORF ir Exon?
ORF ir egzonas yra nukleotidų sekos. ORF reiškia bet kurią DNR sekos atkarpą, esančią tarp starto kodono ir stopkodono. Priešingai, egzonas yra geno, koduojančio aminorūgštis, koduojanti nukleotidų seka. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp ORF ir egzono. Egzonai yra geno dalys, o ilgas ORF greičiausiai yra geno dalis. Be to, abiejose egzono pusėse yra intronų, o ORF neapima intronų.
Toliau infografijoje lentelės pavidalu apibendrinamas skirtumas tarp ORF ir egzono.
Santrauka – ORF vs Exon
Atviras skaitymo rėmelis (ORF) yra skaitymo rėmelio dalis. Tai nuolatinis DNR sekos ruožas, kuris prasideda pradžios kodonu ir baigiasi stop kodonu. Egzonas yra geno nukleotidų seka. Jis koduoja dalį mRNR sekos. Todėl egzonai yra genų sekos dalys, ekspresuojamos b altyme. Taigi čia apibendrinamas skirtumas tarp ORF ir egzono.
