Pagrindinis skirtumas – Metabolomika ir Metabonomika
Metabolitai yra mažos molekulės, dalyvaujančios medžiagų apykaitos reakcijose ląstelėse. Metabolitai apima tarpinius metabolinius produktus, hormonus, antrinius metabolitus, signalines molekules ir kt. Jie yra funkcionuojančios ląstelių biocheminių reakcijų molekulės. Visas biologinio mėginio arba vieno organizmo metabolitų rinkinys yra žinomas kaip metabolomas. Metabolome yra dinamiška kolekcija, kuri kūne keičiasi kas sekundę. Metabolomika ir metabonomika yra du terminai, susiję su organizmo metabolizmo tyrimu. pagrindinis skirtumas tarp metabolomikos ir metabonomikos yra tas, kad metabolomikai labiau rūpi normalus endogeninis metabolizmas ir medžiagų apykaitos profiliavimas ląstelių arba organų lygmeniu, o metabonomika labiau rūpinasi metabolinio profiliavimo išplėtimu, pateikiant informaciją apie medžiagų apykaitos sutrikimus dėl aplinkos veiksnių, ligų, žarnyno. mikroorganizmus ir lyginant medžiagų apykaitos profiliavimą ir kt. Metabolomiką daugiausia lemia masių spektrometrija, o metabolitų analizei metabonomika naudoja BMR spektroskopiją.
Kas yra metabolizmas?
Metabolomika yra medžiagų apykaitos procesų, vykstančių ląstelėse, bioskysčiuose, audiniuose ar organizmuose, tyrimas. Tai apima ląstelių metabolitų identifikavimą ir kiekybinį įvertinimą naudojant geras analitines ir statistines priemones. Metabolomika laikoma svarbiu tyrimu, nes ji atskleidžia informaciją apie organizmo metabolizmą.
Siekdama ištirti medžiagų apykaitos reakcijų substratus ir produktus, metabolomika naudoja masės spektrometriją kaip analitinę platformą. Masių spektrometrija atskleidžia metabolitų tipus ir jų koncentracijas, atspindinčias tikrąją ląstelių ar audinių biocheminę būklę. Taigi metabolomika gali būti laikoma geriausiu organizmo molekulinio fenotipo atstovu. Metabolomika yra mažų organizmų molekulių ominė technologija, palyginti su kitais omikos tyrimais; metabolomika yra labai svarbi, nes ji tiesiogiai atspindi dabartinę ląstelių biocheminės reakcijos būklę.
Metabolomika taip pat gali būti laikoma proteomikos išplėtimu, nes ji susidaro dėl fermentų, kurie yra b altymai, veiklos, kaip parodyta toliau pateiktame paveikslėlyje.
01 pav.: Metabolizmo schema
Kas yra Metabonomika?
Metabonomika apibrėžiama kaip kiekybinis daugiaparametrinių metabolinių reakcijų matavimas tam tikru laiku, atsižvelgiant į patofiziologinius įtempius ar genetinę modifikaciją. Paprastai tai taikoma tyrimams, susijusiems su žmonių mityba ir atsaku į vaistus ar ligas. Šio metodo pradininkas buvo Jeremy Nicholsonas iš Londono Imperial College ir jis buvo naudojamas daugelyje sričių, įskaitant toksikologiją, ligų diagnostiką, mitybą ir kt. Istoriškai metabonomika buvo vienas iš pirmųjų metodų, naudojančių sistemų biologijos apimtį tyrimams. metabolizmo.
Metabonomikai labiau rūpi biocheminių profilių palyginimas, o ne atskirų metabolinių junginių nustatymas metabolomikoje. Todėl metabonomika gali būti apibrėžta kaip metabolomikos pogrupis. Jame daugiausia dėmesio skiriama skirtingų populiacijų medžiagų apykaitos profilių palyginimui, atsižvelgiant į ligas, aplinkos įtempius, genetinę modifikaciją, mitybą, vaistus ir kt., nes metabolitai yra geri žymenys, signalizuojantys apie ligos sąlygas, vaistų poveikį, aplinkos įtempimą, toksinų poveikį. ir tt
Metabonominiai tyrimai atskleidžia tiek tarpląstelinius, tiek tarpląstelinius metabolitus. Jis naudoja didelio našumo metodus, kad vienu metu ir pakartotinai analizuotų daugybę metabolitų, leidžiančių laiku ištirti ląstelių fiziologinę būklę. Tai taip pat atskleidžia ryšį tarp metabolitų ir patologinės organizmo būklės. Norint paremti metabonominius tyrimus, gali būti naudojama genomika ir proteomika, nes jos yra tarpusavyje susijusios, kaip parodyta aukščiau esančiame paveikslėlyje.
Kuo skiriasi metabolizmas ir metabolizmas?
Metabolomika vs metabolomika |
|
Metabolomika yra viso organizmo metabolitų rinkinio tyrimas | Metabonomika – tai kiekybinis gyvų sistemų daugiaparametrinių metabolinių reakcijų į patofiziologinius dirgiklius ar genetinę modifikaciją tyrimas. |
Pagrindinis susirūpinimas | |
Metabolomika labiau rūpinasi medžiagų apykaitos profiliavimu ir atskirų ląstelėse esančių metabolitų nustatymu. | Metabonomika labiau susijusi su metabolitų arba populiacijų metabolinių profilių palyginimu, atsižvelgiant į genetines modifikacijas, ligas, aplinkos įtempimus, patologinius dirgiklius, vaistus ir kt. |
Informacija | |
Metabolomika daugiausia orientuota į endogeninę medžiagų apykaitą. | Metabonomika neapsiriboja endogeniniu metabolizmu. Jame galima rasti informacijos apie medžiagų apykaitos sutrikimus, kuriuos sukelia vidiniai ir išoriniai veiksniai, pvz., mitybos įpročiai, toksinai, ligų procesai ir kt. |
Analitiniai įrankiai | |
Joje naudojama masės spektrometrija kaip pagrindinė analizės platforma | Metabonomics kaip pagrindinę analizės platformą naudoja BMR spektroskopiją. |
Santrauka – Metabolomika prieš Metabonomiką
Metabolomas yra visas mažų molekulių, vadinamų metabolitais, rinkinys ląstelėje arba organizme. Metabolomika yra viso metabolizmo tyrimas, siekiant sukurti metabolizmo profilį. Metabolomika leidžia mokslininkams išmatuoti tikrąją ląstelės ar organizmo fiziologinę būklę. Metabonomika yra metabolomikos dalis, apimanti informaciją apie daugiaparametrines gyvų sistemų metabolines reakcijas į patofiziologinius dirgiklius ir genetines modifikacijas. Metabonomika yra susijusi ne tik su individualiu metabolizmo profiliavimu, pavyzdžiui, metabolomika; jame lyginami medžiagų apykaitos profiliai, palyginti su kitais veiksniais, tokiais kaip aplinkos įtampa, ligos, toksinai ir kt. Tiek metabolomika, tiek metabonomika apima organizmų metabolitų tyrimus, siekiant išmatuoti tikrąją ląstelių fiziologinę būklę. Todėl kartais šie du laikomi sinonimais, neatsižvelgiant į skirtumą tarp metabolomikos ir metabonomikos.