Pagrindinis skirtumas tarp NAAT ir PGR yra tas, kad NAAT yra genetinę medžiagą amplifikuojantis keliais būdais, įskaitant polimerazės grandininę reakciją, grandinės poslinkį arba transkripcijos sukeltą amplifikaciją, o PGR yra metodas, kuris sustiprina genetinę medžiagą naudojant tik šiluminis dviratis.
Patogenai daugiausia identifikuojami pagal jų genetinės medžiagos amplifikaciją. Dauguma šios srities metodų yra skirti patogeno genetinės medžiagos aptikimui realiuoju laiku sustiprinant konkrečias sekas. Todėl diagnostikos kontekste rezultatai gaunami labai greitai. NAAT, PGR, biosensorius ir LCR yra keli metodai, naudojami laboratorijose, siekiant sustiprinti patogeno genetinę medžiagą.
Kas yra NAAT?
Nukleino rūgščių amplifikacijos testas (NAAT) yra molekulinės biologijos metodas, kuriuo genetinė medžiaga amplifikuojama naudojant kelis būdus, pvz., polimerazės grandininę reakciją, grandinės poslinkio amplifikaciją arba transkripcijos sukeltą amplifikaciją. Genetinės medžiagos amplifikacija taip pat gali būti atliekama naudojant tokius metodus kaip surišimo grandininė reakcija ir šakotosios DNR reakcija (quantiplex b DNR) NAAT procedūroje. NAAT naudoja Watson-Crick bazinės poros specifiką. Atliekant NAAT procedūrą, vienos grandinės zondas arba pradmenų molekulė hibridizuojama su tiksline DNR arba RNR molekule. Todėl zondo grandinės konstrukcija yra labai svarbi siekiant padidinti aptikimo jautrumą ir specifiškumą. Tada kitas NAAT veiksmas sustiprina genetinę medžiagą, padarydamas daug jos kopijų aptikimui.
01 pav.: NAAT
NAAT šiuo metu taikomas aptikti kelis patogenus, tokius kaip Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis ir SARS-COV2. Be to, NAAT testas sukurtas siekiant sutrumpinti lango laikotarpį. Lango laikotarpis yra laikotarpis nuo paciento užsikrėtimo iki to momento, kai antikūnų tyrimai rodo, kad jie yra teigiami. Be to, FDA pirmą kartą patvirtino NAAT atrankos metodą 1999 m. NAAT turi daug privalumų, įskaitant žemo DNR arba RNR lygio aptikimą, didelį jautrumą ir didelį specifiškumą.
Kas yra PGR?
PGR yra molekulinės biologijos metodas, kuris sustiprina genetinę medžiagą naudojant tik terminį ciklą. PCR reiškia polimerazės grandininę reakciją. Tai testas, skirtas aptikti konkretaus organizmo, pavyzdžiui, bakterijų, grybelių ir virusų, genetinę medžiagą. Diagnozuojant ligą PGR nustato patogeno buvimą, jei tyrimo metu asmuo turi patogeną. Diagnozuojant ligą PGR protokolas susideda iš kelių etapų, įskaitant mėginių paėmimą, DNR ekstrakciją, PGR ir sekos nustatymą. Tiriant patogenus, surinktas mėginys naudojamas genetinei medžiagai (DNR arba RNR) išgauti. PGR procedūrai reikia specialių cheminių medžiagų, pradmenų ir fermentų, kad PGR aparate, vadinamame terminiu cikleriu, būtų pagaminta milijonai genetinės medžiagos kopijų. Padauginus iš PGR produkto, patogeną galima aptikti. Mokslininkai rezultatams interpretuoti naudoja specialią programinę įrangą.
02 pav.: PCR
Be to, šiuo metu tyrime naudojami įvairūs PGR tipai. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD ir įdėtoji PGR yra keletas iš jų. PGR ypač naudinga nustatant faringitą (streptokokų sukeltą faringitą), atipinę pneumoniją (Chlymydia pneumoniae), tymus (Morbillivirus), hepatitą (HBV) ir opinę urogenitalinę infekciją (Haemophilus ducreyi).
Kokie yra NAAT ir PCR panašumai?
- NAAT ir PGR yra du svarbūs molekulinės biologijos metodai, naudojami genetinei medžiagai amplifikuoti.
- Nukleino rūgštys (DNR arba RNR) amplifikuojamos abiem būdais.
- Tai greiti ir greiti metodai.
- Šiuo metu ligoms diagnozuoti naudojami abu metodai.
- Jie brangesni nei įprasti metodai.
Kuo skiriasi NAAT ir PCR?
NAAT yra molekulinės biologijos metodas, kuris amplifikuoja genetinę medžiagą naudojant kelis metodus, o PGR yra molekulinės biologijos metodas, kuris sustiprina genetinę medžiagą naudojant tik terminį ciklą. NAAT naudoja skirtingus genetinės medžiagos amplifikacijos metodus, tokius kaip polimerazės grandininė reakcija, grandinės poslinkio amplifikacija, transkripcijos tarpininkaujama amplifikacija, ligavimo grandininė reakcija ir šakotosios DNR reakcija (quantiplex b DNA). Kita vertus, PGR naudoja skirtingus genetinės medžiagos amplifikacijos metodus, tokius kaip RT-PGR. Daugkartinis PGR, RAPD, įdėtas PGR. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp NAAT ir PCR.
Toliau pateiktoje infografikoje pateikiami skirtumai tarp NAAT ir PGR lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – NAAT vs PCR
Laboratorijose naudojami įvairūs molekuliniai biologiniai įrankiai genetinėms medžiagoms sustiprinti. NAAT, PGR, biosensorius ir LCR yra keletas tokių metodų. NAAT yra molekulinė biologinė technika, kuri sustiprina genetinę medžiagą keliais būdais, tokiais kaip polimerazės grandininė reakcija, grandinės poslinkis arba transkripcijos sukelta amplifikacija. PGR yra molekulinės biologijos metodas, kuris amplifikuoja genetinę medžiagą naudojant terminį ciklą. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp NAAT ir PGR.
