Pagrindinis skirtumas tarp sudėtinių transpozonų ir IS elementų yra tas, kad sudėtiniai transpozonai yra transpozonų tipas, pernešantis pagalbinius genus, pvz., atsparumo antibiotikams genus, o IS elementai (arba įterpimo sekos elementai) yra perkeliami elementai, kuriuose yra tik tie genai, kurie kodo perkėlimas, kuris katalizuoja perkėlimo veiklą.
A transpozonas yra DNR fragmentas, galintis pakeisti savo vietą bakterijos genome. Todėl tai yra mobilios DNR sekos. Jie persikelia į naujas genomo vietas, pakeisdami bakterijų genomo seką, sukeldami reikšmingus genetinės informacijos pokyčius. Transposonai taip pat žinomi kaip šokinėjantys genai, nes jie gali blokuoti genų transkripciją ir pertvarkyti bakterijos genetinę medžiagą. Be to, jie yra atsakingi už atsparumo vaistams, atsparumo antibiotikams genų judėjimą tarp plazmidžių ir chromosomų. Sudėtiniai transpozonai ir IS elementai yra dviejų tipų mobilieji genetiniai elementai, randami bakterijose. Abu gali pereiti iš vienos genomo vietos į kitą.
Kas yra sudėtiniai transpozonai?
Sudėtinis transpozonas yra DNR segmentas, šalia kurio yra dvi panašių įterpimo sekos elementų kopijos. Kompozitiniame transpozone yra centrinis b altymus koduojantis regionas. Genai dažnai yra antibiotikams atsparūs genai. Juose taip pat gali būti katabolinių genų. Be to, sudėtinis transpozonas susideda iš dviejų apverstų pakartojimų. Visas sudėtinio transpozono ilgis juda kaip vienas pilnas vienetas.
01 pav.: sudėtinis transpozonas
Tn10 yra sudėtinis transpozonas. Jį sudaro 6,5 kb centrinė koduojanti sritis (tetraciklinui atsparus genas) ir 1,4 kb apverstos įterpimo sekos elementai kiekviename gale. IS elementai tiekia transponavimą. Transpozazė yra fermentas, katalizuojantis transpozono judėjimą. Sudėtinius transpozonus galima sustiprinti, kuriant pradmenis IS elementams.
Kas yra IS elementai?
Įterpimo sekos elementai arba IS elementai yra mobilaus genetinio elemento tipas. Jie yra paprasta transpozonų forma. Jie turi tik genus, koduojančius transpozazės fermentus. Transposazės fermentai katalizuoja transpozonų perkėlimą. Struktūriškai IS elementų kodavimo seka yra greta dviejų atvirkštinių pakartojimų. Pavyzdžiui, IS elementas, vadinamas IS911, yra apsuptas dviejų 36 bp apverstų pasikartojančių galūnių.
IS elementai yra gausiausi autonominiai perkeliami elementai bakterijų genome. Taigi jie yra nepaprastai svarbūs prokariotų genomo organizavimui ir evoliucijai. Be to, IS elementai atsiranda kaip sudėtinių transpozonų dalys. Paprastai du IS elementai yra šalia sudėtinio transpozono kodavimo sekos. Tačiau vienetų transpozonai neturi šalia esančių IS elementų.
Kadangi IS elementai gali judėti genome, jie gali nutraukti kitų genų kodavimo seką ir inaktyvuoti genus blokuodami ekspresiją.
Kokie yra sudėtinių transpozonų ir IS elementų panašumai?
- Tiek sudėtiniai transpozonai, tiek IS elementai gali pakeisti padėtį bakterijų genome.
- Kodavimo sritis abiejuose transpozonuose paprastai yra greta atvirkštinių pasikartojimų.
- Sudėtinį transpozoną sudaro du atskiri IS elementai.
Kuo skiriasi sudėtiniai transpozonai ir IS elementai?
Sudėtiniai transpozonai yra mobilūs genetiniai elementai, susidedantys iš dviejų įterpimo sekų (IS), dažnai besiribojančių su vienu ar daugiau atsparumo antibiotikams genų. Kita vertus, IS elementai yra paprastų perkeliamų elementų tipas, kuriame yra genų, koduojančių transpozazės fermentą, kad katalizuoti perkėlimą. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp sudėtinių transpozonų ir IS elementų.
Toliau pateikiamas sudėtinių transpozonų ir IS elementų skirtumų sąrašas lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – sudėtiniai transpozonai vs IS elementai
Bakterijos genomas turi genetinių elementų, kurie yra mobilūs. Sudėtiniai transpozonai ir IS elementai yra dviejų tipų mobilieji genetiniai elementai. Sudėtiniai transpozonai turi antibiotikams atsparius genus ir šalia esančius IS elementus. IS elementai turi genetinį kodą, gaminantį transpozazę, kuri katalizuoja transpozonų judėjimą. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp sudėtinių transpozonų ir IS elementų.
