Pagrindinis skirtumas tarp dATP ir ddATP yra tas, kad dATP nenutraukia DNR sintezės, o ddATP gali nutraukti DNR sintezę. Taip yra todėl, kad ddATP turi H atomą, prijungtą prie pentozės cukraus 3' padėties, o dATP turi OH grupę, prijungtą prie 3' padėties.
dNTP yra DNR statybinė medžiaga. Yra keturi dNTP tipai pagal purino arba pirimidino bazes – vienas iš jų – dATP. Azotinė dATP bazė yra adenozinas. ddNTP yra nukleotidai, naudojami Sangerio sekos nustatymui. Yra keturi ddNTP tipai. ddATP yra ddNTP.
Kas yra dATP?
Deoksiadenozino trifosfatas yra nukleotidas, kuris yra DNR statybinė medžiaga. DNR polimerazės fermentas naudoja dATP kaip DNR sintezės substratą. dATP sudaro trys komponentai: dezoksiribozės cukraus molekulė, adenozinas ir trys fosfato grupės. Todėl tai yra purino nukleozido trifosfatas. Cheminė dATP formulė yra C10H16N5O12 P3, ir jo molekulinė masė yra 491 182.
01 pav.: dATP
dATP skiriasi nuo ATP (adenozintrifosfato) pagal cukraus komponentus. ATP turi ribozės cukraus. dATP bazių poros su uracilo nukleotidu transkripcijos metu. Be dalyvavimo DNR sintezėje, dATP gali veikti kaip energiją pernešanti molekulė, kad išlaikytų ląstelių gyvybingumą. Didelis dATP kiekis organizme yra toksiškas, nes gali veikti kaip nekonkurencinis fermento ribonukleotidų reduktazės inhibitorius. Dėl to gali susilpnėti imuninė funkcija.
Kas yra ddATP?
Dideoksiadenozino trifoafatas arba ddATP yra vienas iš keturių tipų nukleotidų, naudojamų Sangerio sekos nustatymo metodu. Struktūriškai ddATP taip pat turi tris komponentus, panašius į dATP. Jie yra adenino bazė, dezoksiribozės cukrus ir trys fosfatai.
02 paveikslas: ddATP
Skirtingai nei dATP, ddATP neturi OH grupės 3' pentozės cukraus padėtyje, kad susidarytų fosfodiesterio ryšys su gretimu nukleotidu ir tęstų grandinės pailgėjimą. Jis turi H atomą 3' padėtyje. Todėl, įtraukus ddATP, DNR sintezė baigiasi. Tai yra pagrindinis „Sanger“sekos sudarymo principas. Todėl ddATP veikia kaip grandinės pailgėjimo inhibitorius Sangerio sekoje. „Sanger“sekos nustatymui naudojami keturi mėgintuvėliai, o ddATP pridedama prie vieno mėgintuvėlio.
Kokie yra dATP ir ddATP panašumai?
- dATP ir ddATP yra nukleotidai.
- Abu yra sudaryti iš adenino, dezoksiribozės ir trijų fosfatų.
- Jie yra organiniai junginiai.
- Tiek dATP, tiek ddATP yra įtraukiami į mėgintuvėlius pagal Sangerio seką.
Kuo skiriasi dATP ir ddATP?
dATP turi OH grupę 3' pentozės cukraus padėtyje, o ddATP neturi OH grupės pentozės cukraus 3' padėtyje. Be to, dATP yra monomeras, naudojamas DNR sintezei, o ddATP naudojamas grandinės pailgėjimui nutraukti Sangerio sekos nustatymo metu. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp dATP ir ddATP. Be to, dATP gali sudaryti fosfodiesterio ryšius, o ddATP negali sudaryti fosfodiesterinių jungčių.
Toliau infografika rodo daugiau skirtumų tarp dATP ir ddATP lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – dATP vs ddATP
Trumpai tariant, dATP yra DNR sintezės pirmtakas, o ddATP yra nukleotidas, naudojamas nutraukti DNR sintezę atliekant Sangerio seką. Be to, dATP turi OH grupę pentozės cukraus 3' padėtyje ir leidžia susidaryti fosfodiesterio ryšiui su kitu nukleotidu. Tuo tarpu ddATP neturi OH grupės 3ʹ padėtyje; vadinasi, jis negali sudaryti fosfodiesterio jungties su kitu nukleotidu. Dėl to DNR seka nustoja pailgėti. Taigi čia apibendrinamas skirtumas tarp dATP ir ddATP.
