Pagrindinis skirtumas – prieš srovę ir pasroviui DNR
Svarbu turėti bendrų žinių apie DNR sudėtį ir struktūrą, kad suprastumėte skirtumą tarp DNR prieš ir pasroviui. DNR sudaryta iš polinukleotidų grandinių. Nukleotidai yra statybiniai blokai, sukuriantys polinukleotidų grandines, o kiekvienas nukleotidas yra sudarytas iš trijų komponentų: penkių anglies cukraus, azoto bazės ir fosfatų grupės. Fosfato grupė ir OH grupė yra atitinkamai prijungtos prie cukraus molekulės 5' padėtyje esančios anglies ir 3' padėties anglies nukleotidų. Nukleotidai yra sujungti fosfodiesteriniais ryšiais, susidariusiais tarp vieno nukleotido 5' fosfato grupės ir gretimo nukleotido 3' OH grupės. Jei polinukleotidinė grandinė turi laisvą 5’ fosfato grupę, ji priskiriama kaip 5’ galas; jei ji turi laisvą 3’ OH grupę, ji priskiriama kaip 3’ galas. Todėl DNR grandinės paprastai turi 5’ ir 3’ galus pagal polinukleotidinių grandinių galines padėtis. DNR taip pat egzistuoja kaip dvigrandė forma. Dvi sruogos yra viena kitai antilygiagrečios. Todėl DNR turi dvi sruogas, kurios eina 5'-3' kryptimi ir 3'-5' kryptimi. Prieš srovę ir pasroviui esanti DNR vadinama 5'–3' mRNR grandinės transkripcija ir sinteze. Jei manoma, kad DNR yra link 5 koduojančios grandinės galo nuo transkripcijos inicijavimo vietos, ji žinoma kaip prieš srovę DNR. Jei DNR laikoma link 3' galo nuo koduojančios grandinės nuo transkripcijos pradžios vietos, tai vadinama pasroviui DNR. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp DNR prieš ir pasroviui.
Kas yra aukštesnė DNR?
Genas yra struktūrinis ir funkcinis paveldimumo vienetas, esantis organizmo DNR. Jis saugomas kartu su instrukcijomis, kaip sudaryti b altymą. Genas turi tam tikrą DNR molekulės sritį. Jei reikia, jis transkribuoja ir paverčiamas b altymu per mRNR grandinės sintezę. Paprastai koduojanti geno grandinė eina nuo 5 iki 3 colių kryptimi. Kai jis yra transkribuojamas, jis gamina mRNR grandinę ta pačia kryptimi 5'-3'. Transkripcijos metu 3'–5' antisensinė grandinė naudojama kaip šabloninė grandinė ir inicijuoja mRNR sintezę. Gene yra transkripcijos inicijavimo vieta. Kalbant apie transkripcijos inicijavimo vietą, DNR sritis, esanti link koduojančios grandinės 5' galo, yra žinoma kaip DNR prieš srovę. Geno promotorius paprastai yra viršutiniame DNR regione. Eukariotų genuose yra TATA dėžės, proksimaliniai promotoriaus elementai ir stiprintuvai prieš geną. Prieš srovę esantis geno regionas nurodomas neigiamais skaičiais. Prieš srovę esanti geno DNR yra nepaprastai svarbi transkripcijai.
Kas yra žemesnė DNR?
Transkripcijos pradžios vieta žinoma kaip +1 geno taškas. DNR sritis nuo +1 taško link koduojančios grandinės 3' galo yra žinoma kaip pasroviui skirta DNR. Kitaip tariant, pasroviui nuo geno yra nuo transkripcijos pradžios vietos link šablono grandinės 5' galo. Todėl pasroviui esanti geno srities DNR apima transkripcijos vienetą ir kitas sekas, tokias kaip terminatoriaus seka. Promotorius gali paveikti geno seką pasroviui. Žemiau esanti geno dalis nurodoma teigiamais skaičiais. Geno DNR pasroviui yra tikroji sritis, kuri suteikia b altymo produktą.
01 pav. DNR prieš ir pasroviui
Kuo skiriasi aukštesnė ir žemesnė DNR?
DNR prieš srovę |
|
| DNR sritis link koduojančios sekos 5' galo nuo transkripcijos inicijavimo vietos yra žinoma kaip prieš srovę DNR. | DNR sritis link koduojančios grandinės 3' galo nuo transkripcijos pradžios vietos yra žinoma kaip pasroviui DNR. |
| Elementai | |
| Promotoriai ir stiprikliai yra viršutinėje DNR dalyje | Transkripcijos vienetas ir terminatoriaus sekos yra pasrovinėje DNR. |
| Numeravimas | |
| Nukleotidai viršutiniame regione nurodyti neigiamais skaičiais | Nukleotidai nurodomi teigiamais skaičiais. |
| Funkcija | |
| Šiame regione yra elementų, būtinų transkripcijai reguliuoti ir inicijuoti | Šiame regione yra nurodymas gaminti b altymą ir nutraukti transkripciją |
Santrauka – prieš srovę ir pasroviui DNR
Lengva atpažinti RNR grandinę prieš ir pasroviui. Kalbant apie etaloninę vietą, sritis, esanti link RNR grandinės 5' galo, yra žinoma kaip RNR prieš srovę, o sritis link 3' galo yra žinoma kaip pasroviui esanti RNR. Tačiau DNR yra dvi gijos, kurios eina abiem kryptimis nuo 5 iki 3 ir nuo 3 iki 5 colių. Taigi skirtumas tarp DNR prieš srovę ir pasroviui yra sudėtingas. Todėl jis yra diferencijuojamas atsižvelgiant į geno transkripciją. Nuo transkripcijos inicijavimo vietos link jutimo grandinės 5 galo DNR sritis yra žinoma kaip prieš srovę esanti DNR, o nuo transkripcijos iniciacijos vietos link jutimo grandinės 3' galo yra žinoma kaip pasroviui DNR. Tai yra skirtumas tarp DNR prieš ir pasroviui.
