siRNA vs miRNA
RNR yra labai svarbios molekulės, padedančios kurti organizmų gyvybę. Neseniai mokslininkai atrado mažas RNR, vadinamas RNR trukdžiais arba RNRi, kurios veikia po transkripcijos ir kontroliuoja genų ekspresiją. Du pagrindiniai mažų RNR tipai yra mikro RNR arba miRNR ir mažos trukdančios RNR arba siRNR. Šios molekulės iš esmės reguliuoja genų ekspresiją, slopindamos tikslinį geną. Tiek miRNR, tiek siRNR turi labai panašius biogenezės kelius, nors tarp jų yra tam tikrų skirtumų. MiRNR ir siRNR kilmė yra iš dsRNR molekulių. Brandžios miRNR yra struktūriškai panašios į siRNR molekules.
miRNA
Mikro RNR arba miRNR yra mažos RNR molekulės, kurios tarpininkauja galutiniam transliacinio genų reguliavimo patikrinimui. MiRNR reguliavimo panaikinimas gali sukelti vėžį ir kitų ligų vystymąsi. Todėl tinkamas informacijos, užkoduotos nekoduojančiame miRNR regione, reguliavimas yra labai svarbus daugelyje pagrindinių ląstelių procesų.
siRNA
siRNR taip pat vadinamos trumpąja trukdančia arba slopinančia RNR ir yra sudarytos iš dvigrandinės RNR su 20–25 bazių poromis. Pagrindinis siRNR vaidmuo yra trukdyti specifinių genų ekspresijai su papildomomis nukleotidų sekomis. siRNR sudaro trumpa dvigrandė RNR su fosforilintais 5’ galais ir hidroksilintais 3’ galais su dviem išsikišusiais nukleotidais.
Kuo skiriasi siRNR ir miRNR?
• miRNR, gauta iš specifinių genomo lokusų, o siRNR, gauta iš mRNR, transpozonų, virusų arba heterochromatinės DNR.
• MiRNR sintezė apdorojama iš ilgesnių pirmtakų plaukų segtukų nuorašų (pirminė branduolinė miRNR seka naudojant RNazės III endonukleazę), o siRNR sintezė apdorojama iš ilgų bimolekulinių RNR dupleksų.
• Kiekviena miRNR plaukų segtuko pirmtako molekulė sukuria vieną miRNR dvipusį, o kiekviena siRNR pirmtako molekulė gamina kelis siRNR dupleksus.
• siRNR sekos yra retai konservuotos, o miRNR sekos yra gerai konservuotos.
• Visos siRNR bazės prisideda prie tikslinio specifiškumo, tuo tarpu tik 5' pusė miRNR prisideda prie tikslinio specifiškumo.
• miRNR dažnai jungiasi prie 3 colių neišverstos tikslinių nuorašų srities, o siRNR sudaro papildomus dupleksus bet kurioje tikslinės mRNR vietoje.
• miRNR nurodo „hetero nutildymą“, o siRNR naudojama „automatiniam nutildymui“.
• miRNR veikia kaip signalas, neleidžiantis vertimui, o siRNR fiziškai neleidžia vertimui.
