Pagrindinis skirtumas tarp SF1 ir SF2 yra jų gebėjimas išvynioti nukleino rūgštis. SF1 išvynioja tik DNR, o SF2 išvynioja ir DNR, ir RNR.
Helikazė yra vienas iš pagrindinių fermentų, dalyvaujančių DNR replikacijos ir DNR atkūrimo procesuose. Pagrindinis helikazės vaidmuo yra dalyvauti išsivyniojimo procese, kad būtų lengviau atskirti dvigrandines DNR molekules. Fermento aktyvumas yra būtinas DNR replikacijos pradžios fazėje. Helikazės skirstomos į Super Family 1 ir Super Family 2, visų pirma pagal jų struktūrinius skirtumus. Kiekvienoje superšeimoje yra daugiau įvairių helikazių tipų.
Kas yra SF1?
Super Family 1 helikazė yra helikazės tipas, kurį sudaro heksamerinė struktūra kartu su vidiniu šerdies b altymu, vaizduojančiu helikazės aktyvumą. SF1 helikazė yra viena didžiausių helikazės klasių ir gali būti toliau skirstoma į SF1A helikazes ir SF1B helikazes. B altymai, tokie kaip PcrA, Rep ir UvrD, priklauso SF1A helikazių klasei. Palyginimui, tokie b altymai kaip RecA ir Dda priklauso SF1B helikazių klasei. SF1 helikazės funkcijos labai skiriasi. Kai kurios gyvybiškai svarbios SF1 helikazės funkcijos apima DNR replikaciją, DNR rekombinaciją, Okazaki fragmentų apdorojimą, telomerų susidarymą ir DNR pažeidimo nukleotidų iškirpimą. Kai kuriose bakterijų rūšyse SF1 tipo helikazės taip pat dalyvauja padedant horizontaliam genų perdavimui konjugacijos būdu. Be to, virusuose SF1 helikazės padeda viruso replikacijai.
01 pav.: Helicase veiksmas
Yra daug skirtingų motyvų, susijusių su SF1 helikazės struktūra. Juose yra mažiausiai 7 konservuoti motyvai tarp visų skirtingų SF1 helikazių tipų (Q, I, Ia, II, III, IV, V ir VI). SF1 helikazės struktūra yra kristalas, kuriame motyvai yra susitelkę. Tarp motyvų ir DNR surišimo vietos yra būdinga ATP surišimo kišenė. Nekonservuoti domenai yra paskirstyti, kad būtų išlaikytas helikazės molekulės struktūrinis vientisumas. Šie domenai gali skirtis tarp SF1A ir SF1B helikazių.
Kas yra SF2?
Super family 2 helicase yra viena iš pačių įvairiausių helikazės superšeimų grupių. Yra daug tipų SF2 helikazės, pvz., RecQ tipo helikazės, RecG helikazės, Rad3/XPD ir NS3 helikazės. Kai kurie restrikcijos fermentai, tokie kaip I tipo restrikcijos fermentai, taip pat patenka į šią kategoriją. Bendra SF2 helikazių funkcija yra dvigrandės DNR išvyniojimas. Tačiau kai kurios SF2 helikazės rūšys neturi galimybės visiškai veikti kaip helikazės fermentai. SF2 helikazės taip pat plačiai naudojamos RNR apdorojimui. DEAD-box SF2 helikazių šeima dalyvauja apdorojant RNR, įskaitant transkripciją, sujungimą, transliacijos apdorojimą ir RNR-b altymų komplekso surinkimą.
02 pav.: Helicase
SF2 helikazės struktūroje taip pat yra konservuotų motyvų. Tačiau kai kurie domenai šiek tiek skiriasi nuo SF1 helikazės. Juose taip pat yra ATP surišimo domenas, išskyrus DNR surišimo domeną.
Kokie yra SF1 ir SF2 panašumai?
- SF1 ir SF2 rodo helikazės aktyvumą.
- Be to, abu dalyvauja DNR replikacijoje ir rekombinacijoje.
- SF1 ir SF2 sudaryti iš konservuotų motyvų.
- Abu turi ATP surišimo domeną ir DNR surišimo domeną.
- Šios formos yra kelių domenų b altymai.
- Be to, jei bet kurio tipo mutacijos įvyksta, tai sukels žalingą poveikį.
- Tiek SF1, tiek SF2 yra labai svarbūs užtikrinant ląstelių ciklo tęstinumą.
- SF1 ir SF2 randami prokariotuose ir eukariotuose.
Kuo skiriasi SF1 ir SF2?
SF1 ir SF2 yra dvi super helikazės šeimos. Jie rodo didelę įvairovę. Pagrindinis skirtumas tarp SF1 ir SF2 yra tas, kad SF1 pirmiausia dalyvauja DNR išvyniojime, o SF2 taip pat dalyvauja RNR apdorojime transkripcijos ir transliacijos metu. Lyginant skirtingus b altymo motyvus, SF1 ir SF2 pirmiausia skiriasi pagal III ir IV motyvus. Nors SF1 helikazės turi struktūrinį panašumą, jos sudaro toroidines heksamerines struktūras, o SF2 nesudaro šių struktūrinių susitarimų.
Kitas skirtumas tarp SF1 ir SF2 yra tas, kad SF1 helikazės labiau mėgsta adenino nukleotidus, o SF2 helikazės pirmenybę teikia visiems penkiems nukleotidams. Lyginant išsivyniojimo kryptį, SF1 helikazės persikelia tik 5'–3' kryptimi, o SF2 helikazės turi galimybę kartu su nukleorūgštimis persikelti abiem kryptimis.
Toliau pateiktoje infografikoje pateikiami skirtumai tarp SF1 ir SF2 lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – SF1 vs SF2
Helikazės yra labai svarbi ir įvairi fermentų grupė, dalyvaujanti DNR replikacijoje. Tačiau dėl didelės įvairovės fermentai skirstomi į superšeimas. SF1 ir SF2 yra dvi didžiausios helikazių šeimos. Nors SF1 pirmiausia yra susijęs su apdorojimu, susijusiu su DNR, SF2 yra susijęs ir su DNR, ir su RNR apdorojimu. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp SF1 ir SF2. Be to, SF1 ir SF2 taip pat skiriasi savo struktūriniu išdėstymu, nes SF2 nesudaro heksamerinių struktūrų. SF1 ir SF2 helikazėse mutacijos sukels vėžio vystymąsi po ląstelių ciklo ir kitų gyvybiškai svarbių mechanizmų, tokių kaip DNR atstatymo, reguliavimo sutrikimų.
