Pagrindinis skirtumas tarp restrikcijos endonukleazės ir egzonukleazės yra tas, kad restrikcijos endonukleazė yra nukleazės fermentas, atpažįstantis konkrečią DNR seką ir suskaidantis DNR toje sekoje arba šalia jos, o egzonukleazė yra nukleazės fermentas, skaidantis nukleotidus polinukleotidas iš 5' galo arba 3' galo po vieną.
Nukleazės yra fermentai, skaidantys fosfodiesterio ryšius tarp nukleorūgščių nukleotidų. Gyvuose organizmuose jie yra būtini įrankiai daugeliui DNR atkūrimo ląstelėje aspektų. Šių fermentų defektai gali sukelti genetinį nestabilumą ir imunodeficitą. Restrikcijos nukleazės yra specifinės nukleazės, kurių veikimas priklauso nuo konkrečios nukleotidų sekos. Pavyzdys yra restrikcijos endonukleazė. Yra pagrindinė nukleazių klasifikacija, pagrįsta aktyvumo vieta, pvz., endonukleazė ir egzonukleazė. Endonukleazė virškina sritis, esančias tikslinės DNR molekulės viduryje. Egzonukleazė virškina nukleino rūgštis iš galų. Taigi restrikcijos endonukleazė ir egzonukleazė yra dviejų tipų nukleazės fermentai.
Kas yra restrikcijos endonukleazė?
Restrikcijos endonukleazė yra nukleazės fermentas, kuris atpažįsta specifinę DNR seką ir suskaido DNR toje sekoje arba šalia jos. Specifinė DNR seka yra žinoma kaip restrikcijos vieta. Jis taip pat vadinamas restrikcijos fermentu arba restriktaze. Restrikcijos endonukleazė yra labai specifinis fermentas. Tai viena platesnės endonukleazių grupės fermentų klasė. Restrikcijos endonukleazės paprastai skirstomos į penkis tipus, kurie skiriasi savo struktūra ir gebėjimu perpjauti DNR substratą atpažinimo vietoje. Penki tipai yra I tipas, II tipas, III tipas, IV tipas ir V tipas.
01 pav. Restrikcijos endonukleazė
Restrikcijos endonukleazės paprastai randamos bakterijose ir archėjose. Jie suteikia bakterijų apsaugos nuo virusų mechanizmą. Yra žinoma daugiau nei 3600 restrikcijos endonukleazių. Jie atstovauja daugiau nei 250 skirtingų ypatybių. Daugiau nei 3000 iš jų buvo išsamiai ištirta. Be to, daugiau nei 800 iš jų yra parduodami.
Kas yra egzonukleazė?
Egzonukleazė yra nukleazės fermentas, kuris po vieną skaido nukleotidus polinukleotide iš 5’ galo arba iš 3’ galo. Tai vyksta per hidrolizės reakciją, kuri pabaigoje nutraukia fosfodiesterio ryšius tarp nukleotidų. Eukariotai ir prokariotai turi trijų tipų egzonukleazes. Šios egzonukleazės dalyvauja normalioje mRNR apyvartoje. Tai yra 5'-3' egzonukleazė (Xrn1), 3'-5' egzonukleazė ir poli-A specifinė 3'-5' egzonukleazė. 5’–3’ egzonukleazė yra priklausomas dangtelį mažinantis b altymas. 3’–5’ egzonukleazė yra nepriklausomas b altymas. Poli-A specifinė 3’–5’ egzonukleazė taip pat žinoma kaip poli-A specifinė ribonukleazė, dalyvaujanti poli-A uodegos egzonukleolitiniame skaidyme.
02 pav.: egzonukleazė
Ir archėjose, ir eukariotuose RNR skaido daugelio b altymų egzosomų kompleksas, kurį sudaro 3–5 colių ilgio eksoribonukleazės.
Kokie yra restrikcijos endonukleazės ir egzonukleazės panašumai?
- Restrikcijos endonukleazė ir egzonukleazė yra dviejų tipų nukleazės fermentai.
- Abu fermentai pjauna DNR molekules.
- Šių fermentų yra prokariotuose.
- Jie yra b altymai.
Kuo skiriasi restrikcijos endonukleazė ir egzonukleazė?
Restrikcijos endonukleazė yra nukleazės fermentas, atpažįstantis konkrečią DNR seką ir skaidantis DNR toje sekoje arba šalia jos, o egzonukleazė yra nukleazės fermentas, kuris skaido nukleotidus polinukleotide iš 5' arba 3' galo. po viena. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp restrikcijos endonukleazės ir egzonukleazės. Be to, restrikcijos endonukleazė randama tik prokariotuose, o egzonukleazė randama ir prokariotuose, ir eukariotuose.
Toliau pateiktoje infografijoje pateikiami skirtumai tarp restrikcijos endonukleazės ir egzonukleazės lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – Restrikcijos endonukleazė prieš egzonukleazę
Nukleazės yra fermentai, kurie nutraukia fosfodiesterio ryšius tarp nukleorūgščių nukleotidų. Restrikcijos endonukleazė ir egzonukleazė yra dviejų tipų nukleazės fermentai. Restrikcijos endonukleazė yra nukleazės fermentas, kuris atpažįsta specifinę DNR seką ir suskaido DNR toje sekoje arba šalia jos. Egzonukleazė yra nukleazės fermentas, kuris po vieną skaido nukleotidus polinukleotide iš jų 5' galo arba 3' galo. Taigi čia apibendrinamas skirtumas tarp restrikcijos endonukleazės ir egzonukleazės.
