Pagrindinis skirtumas tarp LAMP ir PGR testo yra tas, kad LAMP atliekama pastovioje temperatūroje (60-650C), kad būtų gautos DNR kopijos amplifikacijos būdu, o PGR atliekama. naudojant temperatūros pokyčius, kad būtų sukurtos DNR kopijos amplifikacijos būdu.
LAMP ir PGR yra in vitro amplifikacijos metodai, naudojami tūkstančiams DNR kopijų gaminti. LAMP pagamintos DNR kiekis yra daug didesnis nei kiekis, pagamintas naudojant PGR metodus, tokius kaip RT-PGR. LAMP yra naujesnė technika, palyginti su PGR technika. Tačiau tai techniškai paprasta ir lengva atlikti apmokytam mokslininkui laboratorinėmis sąlygomis. Dėl to tai gali būti naudinga COVID-19 aptikimo technika. Tačiau RT-PGR yra dabartinis standartinis COVID-19 testas. Nors šie metodai yra gerai žinomi mokslininkams ir gydytojams, turintiems patirties DNR amplifikacijos srityje, vis tiek gali būti gana nežinomi platesnei bendruomenei.
Kas yra lempos testas?
Kilpinis izoterminis amplifikavimas (LAMP), skirtas COVID-19 tyrimams, prasideda mėginių paėmimu iš nosies arba gerklės naudojant tamponą. Mėginius taip pat galima paimti naudojant kitus metodus, pvz., gleives nuo sunkaus kosulio. Kaip ir naudojant PGR metodą, pvz., RT-PGR, mėginyje esanti virusinė RNR pirmiausia paverčiama DNR, kuri leidžia ją nukopijuoti. LAMP reakcija vykdoma pastovioje temperatūroje (60-650C).
Virusinės DNR, apimančios LAMP technologiją ir reagentus, amplifikaciją galima aptikti, kai reakcijos mišinys tampa drumstas dėl „magnio pirofosfato“gamybos. Dėl šio debesuotumo mokslininkai ir gydytojai gali lengvai diagnozuoti COVID-19. Tyrimo rezultatų tikslumą galima pagerinti reakcijos mišinyje naudojant specialius fluorescencinius dažus arba spalvą keičiančius dažus. Šie dažai sąveikauja su viruso DNR, todėl galima išmatuoti šviesos ar spalvos pasikeitimo intensyvumą, kad būtų gautas viruso RNR molekulių skaičius, maždaug toks, koks buvo iš pradžių mėginyje.
Kas yra PGR testas?
PGR yra labai paplitusi mokslinė metodika, kuri jau 20–30 metų plačiai naudojama tyrimuose ir medicinoje DNR aptikti. PGR testai yra naudojami tiesiogiai aptikti antigeną, nustatant viruso RNR. Paprastai viruso RNR yra organizme prieš aptinkant antikūnus arba pasireiškiant ligos simptomams. Todėl PGR testas gali nustatyti, ar kažkas anksti užsikrėtė virusu, ar ne. Šiuo metu PGR yra standartinis COVID-19 nustatymo testas. Yra įvairių tipų PGR metodų, tokių kaip realaus laiko PGR, įdėtoji PGR, multipleksinė PGR, karštojo paleidimo PGR ir ilgojo nuotolio PGR ir kt. PGR naudoja daugybę temperatūros pokyčių, kad amplifikacijos būdu būtų sukurtos DNR kopijos.
RT-PCR yra speciali PGR technikos versija. Jis naudojamas, kai aptinkama RNR. Dabar jis naudojamas COVID-19 testavimui. RT-PGR yra gana jautri ir patikima technika. Atliekant RT-PGR, paėmus mėginį, chemikalai naudojami nepageidaujamiems b altymams, riebalams ir kitoms molekulėms pašalinti, paliekant RNR. Tyrimo rinkinio fermentai pirmiausia paverčia RNR į DNR, kuri vėliau amplifikuoja viruso DNR, kad aptiktų virusą. Fluorescenciniai dažai paprastai naudojami prisijungti prie amplifikuotos DNR ir gaminti šviesą. Tai gali nuskaityti aparatas, kad gautų bandymo rezultatą.
Kokie yra LAMP ir PGR testo panašumai?
- Tai yra stiprinimo būdai.
- Abu sukuria nukopijuotą DNR.
- Jie yra labai jautrūs ir patikimi metodai nei imuninė technika, pvz., antikūnų aptikimas.
- Jie abu naudojami COVID-19 testavimui.
Kuo skiriasi LAMP ir PGR testas?
Pagrindinis skirtumas tarp LAMP ir PGR testų yra tas, kad naudojant LAMP amplifikacija pasiekiama naudojant pastovią temperatūrą (60-650C), o atliekant PGR, ciklinis reikalingos temperatūros. Šiuo metu yra keletas LAMP technikų tipų. Tačiau svarbiausi COVID-19 aptikimo būdai yra atvirkštinės transkripcijos ciklo tarpininkaujama izoterminė technika (RT-LAMP) ir transkripto tarpininkaujama stiprinimas (TMA). Be to, šiuo metu klinikinėje praktikoje yra įvairių tipų PGR metodų, skirtų ligų diagnostikai, pvz., realaus laiko PGR, RT-PGR, įdėtoji PGR, multipleksinė PGR, karštojo paleidimo PGR, ilgojo nuotolio PGR ir kt.
Toliau pateiktoje infografikoje lentelės pavidalu pateikiami skirtumai tarp LAMP ir PGR testų.
Santrauka – LAMP ir PGR testas
Kilpinis izoterminis amplifikavimas yra panašus į PGR testus, tokius kaip RT-PGR, tačiau jis sukuria daugiau viruso DNR kopijų esant pastoviai temperatūrai. Polimerazės grandininės reakcijos testas šiuo metu yra labiausiai paplitusi ir standartinė tyrimų forma pasaulyje diagnozuojant ligas, tokias kaip COVID-19. Tai vertinama kaip gana patikima. PGR naudoja daugybę temperatūros pokyčių, kad amplifikacijos būdu būtų sukurtos DNR kopijos. Taigi čia apibendrinamas skirtumas tarp LAMP ir PGR testo.
