Pagrindinis skirtumas tarp CDS ir cDNR yra tas, kad CDS arba koduojanti seka yra transkripto dalis, kuri iš tikrųjų paverčiama b altymu, o cDNR seka yra DNR seka, gauta iš mRNR atvirkštinės transkripcijos būdu.
A genas yra nukleotidų seka, koduojanti b altymą. Jį sudaro skirtingi regionai kaip promotoriaus sritis, transkripcijos inicijavimo vieta, egzonai, pradžios kodonas, intronai ir stop kodonas. Todėl genas turi ir koduojančias, ir nekoduojančias sekas. Kodavimo sekos arba CDS reiškia egzonus ir du kodonus, kurie yra pradžios kodonas ir pabaigos kodonas. Tai seka, kuri iš tikrųjų paverčiama b altymu. Priešingai, kDNR yra DNR seka, gauta iš mRNR atvirkštinės transkripcijos būdu.
Kas yra CDS?
CDS arba koduojanti seka yra geno dalis, kuri iš tikrųjų paverčiama b altymu. Jį sudaro egzonai ir du kodonai kaip AUG kodonas ir stopkodonas. Skirtingai nuo cDNR, CDS neturi dviejų neišverstų sričių: 5' UTR ir 3 UTR. Be to, intronai neįtraukti į CDS.
01 pav.: kodavimo seka
Palyginus su visu genomu ir asmeniu, koduojančios sekos yra nedidelė dalis. Kodavimo seka susideda iš būtinos nukleotidų sekos, kad būtų sudaryta b altymo aminorūgščių seka.
Kas yra cDNR?
cDNR arba komplementari DNR yra DNR seka, sukurta iš mRNR sekos. Jį sintezuoja procesas, vadinamas atvirkštine transkripcija. Fermentas atvirkštinė transkriptazė katalizuoja kDNR sintezę, o mRNR seka veikia kaip kDNR sintezės šablonas. Iš esmės eukariotinių ląstelių mRNR gali būti ekstrahuojama ir išgryninta, kad būtų sukurta cDNR. Sukūrus cDNR iš mRNR, jie gali būti klonuojami į bakterijų ląstelę, kad būtų sukurtos cDNR bibliotekos. cDNR bibliotekos yra svarbios analizuojant koduojančius regionus, genų funkcijas ir genų ekspresiją ir kt.
02 pav.: cDNR
Skirtingai nei kodavimo seka, cDNR turi du UTR, kurie yra 3' UTR ir 5' UTR. Panašiai kaip kodavimo seka, cDNR neturi intronų.
Kokie yra CDS ir cDNR panašumai?
- CDS ir cDNR yra nukleorūgštys.
- Jie pagaminti iš dezoksiribonukleotidų.
- Tiek CDS, tiek CDNA nėra intronų, kurie yra nekoduojantys regionai.
- Abu turi genetinį kodą arba informaciją b altymui gaminti.
Koks skirtumas tarp CDS ir cDNR?
CDS arba koduojanti seka yra geno dalis, kuri iš tikrųjų paverčiama b altymu. Kita vertus, cDNR seka yra DNR seka, gauta iš mRNR atvirkštinės transkripcijos būdu. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp CDS ir cDNA. Be to, CDS susideda iš egzonų ir dviejų kodonų, kurie yra pradžios kodonas ir stopkodonas. Priešingai, cDNR susideda iš visos mRNR sekos ir dviejų UTR.
Be to, cDNR sintezė atliekama dirbtinai iš mRNR atvirkštinės transkripcijos būdu, o CDS randama genominėje DNR.
Toliau infografika rodo daugiau palyginimų, kad būtų galima atskirti CDS ir cDNR.
Santrauka – CDS vs cDNA
Kodavimo seka ir cDNR yra dviejų tipų nukleotidų sekos. Kodavimo seka yra geno viduje, o cDNR sintetinama dirbtinai. Koduojanti seka turi egzonus ir du kodonus, o cDNR turi mRNR seką ir du UTR. Tiek CDS, tiek cDNR turi tik nukleotidų sekas, kurios iš tikrųjų virsta b altymu. Juose nėra intronų. Skirtingai nuo CDS, cDNR sintezės procesui reikalingas atvirkštinės transkriptazės fermentas. Be to, cDNR gali konvertuoti į cDNR bibliotekas. Taigi čia apibendrinamas skirtumas tarp CDS ir cDNR.
