Pagrindinis skirtumas tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės yra savybės, naudojamos b altymams atskirti gelio elektroforezės metu. 1D gelio elektroforezė atskiria b altymus tik pagal molekulinę masę, o 2D gelio elektroforezė atskiria b altymus pagal jų izoelektrinį tašką ir molekulinę masę.
B altymų atskyrimas gelio elektroforeze yra svarbus b altymų apibūdinimo metodas. B altymai turi įvairių savybių; todėl atskyrimas yra sudėtingesnis, palyginti su DNR atskyrimu agarozės gelio elektroforeze.
Kas yra 1D gelio elektroforezė?
1D Gelio elektroforezė, dar žinoma kaip vienos dimensijos gelio elektroforezė, yra b altymų atskyrimo pagal molekulinę masę metodas. B altymų atskyrimas daugiausia vyksta naudojant poliakrilamido gelio elektroforezę. Remiantis gelio elektroforezės koncepcija, molekulės išsiskiria pagal jų molekulinės masės ir krūvio savybę.
Todėl, kad b altymai būtų vienodai įkrauti, prieš gelio elektroforezę apdorojama natrio dodecilsulfatu (SDS). SDS denatūruoja b altymus ir suteikia vienodą neigiamą b altymo krūvį; kai veikia elektrinis laukas, b altymai migruoja į teigiamą galą pagal savo molekulinę masę. Taigi, atskyrimo metu laikomas tik vienas turtas. Štai kodėl šis metodas vadinamas 1D gelio elektroforeze.
01 pav.: 1D gelio elektroforezė
1D gelio elektroforezės metu b altymai yra atskiriami pagal jų molekulinę masę. Šiuo atžvilgiu mažesnės masės molekulės greičiau migruoja gelyje, palyginti su didelės molekulinės masės b altymais. Taigi didelio svorio b altymai lieka šalia šulinių.
Kas yra 2D gelio elektroforezė?
2D gelio elektroforezė arba dvimatė gelio elektroforezė atskiria b altymus pagal dvi savybes. Dvi savybės yra b altymo izoelektrinis taškas ir molekulinė masė. Šis b altymų atskyrimo būdas padidina b altymų atskyrimo skiriamąją gebą. B altymų izoelektrinis taškas priklauso nuo pH, kuriame b altymas yra neutralus.
02 pav.: 2D gelio elektroforezė
Taigi, atliekant 2D gelio elektroforezę, b altymui leidžiama veikti fiksuotu pH gradientu pirmoje dimensijoje. Antroje dimensijoje b altymai atskiriami vertikalia arba horizontalia poliakrilamido gelio elektroforeze. Taigi b altymai atsiskiria pagal jų molekulinę masę antrajame matmenyje.
Be to, šis gelio elektroforezės metodas padidina b altymų atskyrimo skiriamąją gebą. Todėl atskirti b altymai yra grynesni. Tačiau technikos kaina yra daug didesnė nei vienos dimensijos gelio elektroforezės.
Kokie yra 1D ir 2D gelio elektroforezės panašumai?
- Abu metodai atskiria b altymus.
- Todėl jie svarbūs apibūdinant b altymus.
Kuo skiriasi 1D ir 2D gelio elektroforezė?
Pagrindinis skirtumas tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės yra tas, kad taikant 1D gelio elektroforezę b altymai atskiriami tik pagal molekulinę masę, o 2D gelio elektroforezės būdu b altymai atskiriami pagal izoelektrinį tašką ir molekulinę masę. Dėl šio pagrindinio skirtumo tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės b altymų atskyrimo skiriamoji geba ir dviejų metodų kaina taip pat skiriasi.2D gelio elektroforezė rodo didesnę skiriamąją gebą nei 1D gelio elektroforezė. Tačiau 2D gelio elektroforezė yra brangesnė nei 1D gelio elektroforezė.
Toliau pateiktame infografike apibendrinamas skirtumas tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės.
Santrauka – 1D ir 2D gelio elektroforezė
B altymų atskyrimas priklauso nuo daugelio veiksnių. 1D gelio elektroforezė atskiria b altymus tik pagal molekulinę masę. Tačiau dvimatė arba 2D gelio elektroforezė padidina b altymų atskyrimo skiriamąją gebą. Be to, 2D gelio elektroforezė atskiria b altymus pagal izoelektrinį tašką ir molekulinę masę. Todėl šie duomenys yra svarbūs tolesniam b altymų apdorojimui ir proteomikos srityje. Taigi, tai yra skirtumo tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės santrauka.
