Pagrindinis skirtumas tarp tikslinės ir netikslinės proteomikos yra tas, kad tikslinės proteomikos tikslas yra išmatuoti konkretaus b altymo gausą, o netikslinė proteomika nėra nukreipta į konkretų b altymą.
Proteomika yra didelio masto b altymų, jų struktūrų ir funkcijų tyrimas. Jis tiria visą b altymo komplementą ląstelėje, audinyje ar organizme tam tikromis sąlygomis. Yra dviejų tipų proteomika: tikslinė proteomika ir netikslinė proteomika.
Kas yra tikslinė proteomika?
Kaip rodo pavadinimas, tikslinė proteomika nukreipta į specifinį b altymą arba peptidą sudėtingame b altymų mišinyje analizei. Tada jis analizuoja to iš anksto pasirinkto specifinio b altymo buvimą ir kiekį. Šis metodas galimas tik vienam mėginiui arba keliems mėginiams. Šis metodas tinka net konkrečiai b altymų grupei. Dėl to gaunami tikslesni, kiekybiniai ir jautresni duomenys. Be to, masės spektrometrija kartu su tiksline proteomika suteikia tikslesnius ir patikimus matavimus. Šio metodo analizei naudojamas trigubas kvadrupolio masės spektrometras (QQQ).
01 pav.: Proteomika
Tikslinė proteomika yra tinkamas metodas, jei norite patikrinti, ar numuštas taikinys iš tikrųjų buvo numuštas, arba kai norite kiekybiškai įvertinti konkretų b altymą / peptidą kraujo serume, smegenų skystyje ar ląstelių lizate ir pan. naudokite jį, jei norite patikrinti, ar konkretus b altymas yra skirtingai išreikštas mėginiuose arba laiko trukmės eksperimento metu.
Kas yra netikslinė proteomika?
Netikslinė proteomika, kaip minima pavadinime, analizei netaikoma konkretiems b altymams ar peptidams. „Discovery proteomics“yra kitas „Untargeted proteomics“pavadinimas. Tiesą sakant, tai labiau „pasaulinė“analizė. Paprastai atliekant netikslinę proteomiką reikia atsakyti į klausimą „koks b altymas ar b altymai yra šiame mėginyje ar keliuose mėginiuose? Šis metodas nėra jautrus kaip tikslinė proteomika. Tačiau jis gali nustatyti ir išmatuoti daugybę b altymų, įskaitant naujus b altymus. Netikslinė proteomika gali atlikti tiek kiekybinius, tiek kokybinius matavimus.
Kokie yra tikslinės ir netikslinės proteomikos panašumai?
- Tiek tikslinė, tiek netikslinė proteomika matuoja b altymus mėginiuose.
- Jie svarbūs proteomų analizei.
- Šiuose metoduose naudojama masės spektrometrija.
Koks skirtumas tarp tikslinės ir netikslinės proteomikos?
Pirma, tikslinė proteomika yra konkretaus b altymo ar peptido buvimo ir kiekio kompleksiniame b altymų mišinyje nustatymas. Priešingai, netikslinė proteomika yra kiekybinis ir kokybinis b altymų, esančių mėginyje ar mėginiuose, tyrimas, netaikant konkretaus b altymo. Tikslinė proteomika atliekama su iš anksto atrinktais arba tiksliniais b altymais, o tikslinė proteomika atliekama siekiant išsiaiškinti šio mėginio b altymų tipus. Be to, tikslinė proteomika yra jautresnė nei netikslinė proteomika.
Santrauka – tikslinė ir netikslinė proteomika
Apibendrinant galima pasakyti, kad tikslinė ir netikslinė proteomika yra dviejų tipų b altymų tyrimai. Kaip rodo jų pavadinimai, tikslinė proteomika nukreipta į konkretų b altymą, o netikslinė proteomika nėra nukreipta į konkretų b altymą. Tai yra skirtumas tarp tikslinės ir netikslinės proteomikos.
