Pagrindinis skirtumas tarp DNR transpozonų ir retrotranspozonų yra tas, kad DNR transpozonai yra mobilūs genetiniai elementai, kurie, naudojant iškirpimo ir įklijavimo mechanizmą, juda iš vienos vietos į kitą genome, o retrotransposonai yra mobilūs genetiniai elementai, judantys iš vienos vietos. į kitą genomą naudojant kopijavimo ir įklijavimo mechanizmą.
Mobilieji genetiniai elementai (MGE) yra DNR segmentai, koduojantys specifinius fermentus ir b altymus, kurie tarpininkauja jų judėjimui genome arba kurie gali būti perkelti iš vienos rūšies į kitą. Jie taip pat žinomi kaip savanaudiški genetiniai elementai. Perkeliami elementai yra vienas iš kelių mobiliųjų genetinių elementų tipų. Yra du pagrindiniai perkeliamų elementų tipai: DNR transpozonai ir retrotranspozonai. Todėl DNR transpozonai ir retrotranspozonai yra mobilūs genetiniai elementai, kurie gali judėti iš vienos vietos į kitą genome.
Kas yra DNR transpozonai?
DNR transpozonai yra mobilūs genetiniai elementai, kurie, naudojant iškirpimo ir įklijavimo mechanizmą, perkeliami iš vienos genomo vietos į kitą. Jie priklauso II klasės perkeliamiems elementams, kurie juda per DNR tarpinę medžiagą. Tai prieštarauja I klasės perkeliamiems elementams (retrotranspozonams), kurie juda per tarpinį RNR. Paprastai DNR transpozonai genome juda naudodami iškirpimo ir įklijavimo metodą. Šiam metodui reikalingas transpozazės fermentas, kuris katalizuoja DNR judėjimą iš dabartinės vietos genome ir įterpimą į naują vietą.
01 pav.: DNR transpozonai
Šiai perkėlimui reikia trijų DNR vietų transpozone (po dvi kiekviename transpozono gale, vadinamos galiniais apverstais pasikartojimais, ir vienos tikslinėje vietoje). Transpozazės fermentas prisijungs prie galinių apverstų transpozono pakartojimų ir tarpininkauja transpozono galų sinapsei. Tada transpozazės fermentas atjungia elementą nuo pradinės donoro vietos besiribojančios DNR ir tarpininkauja transpozono prisijungimui prie naujos genomo įterpimo vietos. Transpozono pridėjimas prie naujos vietos sukelia trumpus tarpus abiejose įterpto segmento pusėse. Pagrindinės sistemos ištaiso šias spragas, todėl susidaro tikslinės sekos dubliavimas (TSD), būdingas perkėlimui.
Kas yra retrotranspozonai?
Retrotranspozonai yra mobilūs genetiniai elementai, kurie, naudojant kopijavimo ir įklijavimo mechanizmą, perkeliami iš vienos genomo vietos į kitą. Jie priklauso I klasės perkeliamiems elementams. I klasės perkeliami elementai (retrotranspozonai) juda per RNR tarpinį genomą. Jie yra tam tikro tipo genetinis komponentas, kuris kopijuoja ir įklijuoja save į skirtingas genomo vietas.
02 pav.: retrotranspozonai
Pirma, jie transkribuojami iš DNR į RNR. Tada pagaminta RNR atvirkštiniu būdu transkribuojama į DNR. Ši nukopijuota DNR vėliau įterpiama atgal į genomą naujoje vietoje. Atvirkštinę transkripciją katalizuoja atvirkštinė transkriptazė. Atvirkštinę transkriptazę dažnai užkoduoja pats retrotransposonas. Integraciją atlieka fermentas, vadinamas integraze. Be to, dažniausiai yra trijų tipų: ilgi terminaliniai pasikartojimai (LTR), ilgi tarpiniai branduoliniai elementai (LINE) ir trumpi įsiterpę branduoliniai elementai (SINE).
Kokie yra DNR transpozonų ir retrotranspozonų panašumai?
- DNR transpozonai ir retrotranspozonai yra mobilūs genetiniai elementai.
- Abu klasifikuojami pagal perkeliamus elementus.
- Abu žinomi kaip šokinėjimo genai.
- Jie gali judėti iš vienos vietos į kitą genome.
- Jie evoliuciškai labai svarbūs.
Kuo skiriasi DNR transpozonai ir retrotranspozonai?
DNR transpozonai yra mobilūs genetiniai elementai, kurie perkelia iš vienos genomo vietos į kitą naudojant iškirpimo ir įklijavimo mechanizmą, o retrotranspozonai yra mobilūs genetiniai elementai, kurie perkeliami iš vienos genomo vietos į kitą naudojant kopiją ir pastos mechanizmas. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp DNR transpozonų ir retrotransposonų. Be to, DNR transpozonai priklauso II klasės perkeliamiems elementams, o retrotranspozonai priklauso I klasės perkeliamiems elementams.
Toliau pateiktoje infografijoje pateikiami skirtumai tarp DNR transpozonų ir retrotranspozonų lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – DNR transpozonai prieš retrotranspozonus
DNR transpozonai ir retrotranspozonai yra mobilūs genetiniai elementai. DNR transpozonai perkeliami iš vienos genomo vietos į kitą, naudojant supjaustytos pastos mechanizmą. Retrotransposonai perkeliami iš vienos genomo vietos į kitą, naudojant kopijavimo ir įklijavimo mechanizmą. Taigi, čia apibendrinamas skirtumas tarp DNR transpozonų ir retrotranspozonų.
