Pagrindinis skirtumas tarp T4 DNR ligazės ir E. coli DNR ligazės yra tas, kad T4 DNR ligazė yra fermentas, išskiriamas iš bakteriofago T4, o E. coli DNR ligazė yra fermentas, išskiriamas iš E. coli bakterijos..
DNR ligazė yra specifinis fermento tipas, kuris palengvina DNR grandinių sujungimą formuojant fosfodiesterio ryšį. Jis atlieka svarbų vaidmenį atstatydamas vienos grandinės ir dviejų grandžių pertraukas gyvų organizmų DNR. Be to, DNR ligazė naudojama tiek DNR taisymui, tiek DNR replikacijai. Be pirmiau minėtų naudojimo būdų, DNR ligazė taip pat plačiai naudojama molekulinės biologijos eksperimentuose, tokiuose kaip rekombinantinės DNR technologija. T4 DNR ligazė ir E. coli DNR ligazė yra dviejų tipų DNR ligazės fermentai.
Kas yra T4 DNR ligazė?
T4 ligazė yra DNR jungiantis fermentas, išskirtas iš bakteriofago T4. T4 bakteriofagas yra virusas, užkrečiantis Escherichia coli. T4 ligazės fermentas yra dažniausiai naudojama DNR ligazė molekulinės biologijos laboratoriniuose tyrimuose. Paprastai T4 ligazė katalizuoja dviejų vientisų arba bukais dvigubos grandinės DNR grandžių sujungimą tarp gretimų nukleotidų 5' fosfato ir 3' hidroksilo grupių. Jis taip pat gali katalizuoti RNR prisijungimą prie DNR arba RNR grandinės dvipusėje molekulėje. Tačiau šis fermentas neprisijungs prie vienos grandinės nukleino rūgščių. Be to, jis taip pat gali surišti bukas DNR daug efektyviau nei E. coli DNR ligazė.
01 pav.: T4 DNR ligazė
Šis fermentas reikalauja ATP kaip kofaktoriaus. Kai kurie genų inžinerijos tyrimų eksperimentai jau sukūrė aktyvesnius DNR ligazės fermentus nei laukinio tipo T4 DNR ligazė. Viename iš būdų jie sukūrė sintezės fermento molekulę, sujungdami T4 DNR ligazę su p50 arba NF-kB molekule. Šis naujas T4 ligazės fermentas klonavimo tikslais buvo 160% aktyvesnis nei laukinio tipo T4 DNR ligazė. Be to, optimali temperatūra T4 DNR ligazei tiksliau katalizuoti surišimo reakciją yra 16 °C.
Kas yra E Coli DNR ligazė?
E. coli DNR ligazė yra fermentas, išskirtas iš E. coli bakterijų. Genas, atsakingas už E. coli DNR ligazės gamybą, yra lig genas. E. coli DNR, ligazė ir dauguma prokariotų DNR ligazių naudoja energiją, kurią gauna NAD (nikotinamido adenino dinukleotidas), kad sukurtų fosfodiesterio ryšį.
02 pav.: E. Coli DNR ligazė
E. coli DNR ligazė yra ligavimo fermentas, galintis sujungti DNR fragmentus, katalizuodamas fosfodiesterio jungčių susidarymą tarp dvigrandžių DNR fragmentų, turinčių 5' fosfato galus ir 3' hidroksilo galus. Be to, jis nesuriša bukos galo DNR, išskyrus specialias sąlygas, tokias kaip molekulinis išstūmimas polietilenglikoliu. Jis taip pat negali efektyviai sujungti RNR su DNR. Be to, E. coli DNR ligazės aktyvumą gali sustiprinti tinkamos koncentracijos DNR polimerazės 1 buvimas. Tačiau kai DNR polimerazės 1 fermento koncentracija yra didesnė, tai neigiamai veikia E. coli DNR ligazės aktyvumą.
Kokie yra T4 DNR ligazės ir E coli DNR ligazės panašumai?
- T4 DNR ligazė ir E-coli DNR ligazė yra dviejų tipų DNR ligazės fermentai.
- Abu yra b altymai, sudaryti iš aminorūgščių.
- Šie fermentai katalizuoja fosfodiesterio jungties susidarymą tarp greta esančių 5' fosfato ir 3' hidroksilo galų dvipusėje DNR.
- Jos plačiai naudojamos atliekant molekulinės biologijos eksperimentus, pvz., rekombinantinės DNR technologiją.
Kuo skiriasi T4 DNR ligazė ir E coli DNR ligazė?
T4 DNR ligazė yra fermentas, išskirtas iš bakteriofago T4, o E. coli DNR ligazė yra fermentas, išskiriamas iš E. coli bakterijų. Taigi tai yra pagrindinis skirtumas tarp T4 DNR ligazės ir E. coli DNR ligazės. Be to, T4 DNR ligazės energijos š altinis yra ATP. Kita vertus, E. coli DNR ligazės energijos š altinis yra NAD.
Toliau pateiktoje infografikoje pateikiami skirtumai tarp T4 DNR ligazės ir E coli DNR ligazės lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – T4 DNR ligazė prieš E coli DNR ligazę
T4 DNR ligazė ir E. coli DNR ligazė yra du fermentai, kurie katalizuoja fosfodiesterio jungties susidarymą tarp greta esančių 5’ fosfato ir 3’ hidroksilo galų dvipusėje DNR. T4 ligazė yra fermentas, išskirtas iš bakteriofago T4, o E. coli DNR ligazė yra fermentas, išskirtas iš E. coli bakterijų. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp T4 DNR ligazės ir E coli DNR ligazės.
