Pagrindinis skirtumas tarp DNR be ląstelių ir cirkuliuojančio naviko DNR yra tas, kad DNR be ląstelių yra įvairios DNR formos, kurios laisvai cirkuliuoja kraujyje, o cirkuliuojanti naviko DNR yra fragmentuota iš naviko gauta DNR, kuri cirkuliuoja kraujyje.
Ląstelių neturinti DNR ir cirkuliuojančio naviko DNR yra dviejų tipų cirkuliuojančios nukleino rūgštys. Cirkuliuojančias nukleino rūgštis 1948 m. atrado Mandelis ir Metalas. Vėliau buvo nustatyta, kad sergančių pacientų cirkuliuojančių nukleino rūgščių kiekis yra labai didelis. Šis atradimas pirmą kartą buvo atliktas sergant vilklige. Be to, cirkuliuojančios nukleorūgštys turi didesnę prognostinę vertę ir gali būti naudojamos kaip biomarkeris įvairioms ligoms nustatyti.
Kas yra DNR be ląstelių?
DNR be ląstelių (Cf DNR) reiškia įvairias DNR formas, tokias kaip cirkuliuojantis naviko DNR, mitochondrijų DNR be ląstelių ir vaisiaus DNR be ląstelių ir kt., kurios laisvai cirkuliuoja kraujyje. Padidėjęs ląstelių neturinčios DNR kiekis stebimas sergant pažengusiomis ligomis, tokiomis kaip vėžys, trauma, sepsis, miokardo infarktas, diabetas, insultas, pjautuvinė anemija ir kt. Be vėžio ir vaisiaus gydymo, DNR be ląstelių yra naudingas biologinis žymeklis daugybė negalavimų. Ši DNR taip pat gali būti naudojama transplantato atmetimui nustatyti. Jie taip pat naudojami nustatant įprastą stresą, prenatalinę lytį ir tiriant tėvystę.
01 paveikslas: DNR be ląstelių
Ląstelių neturinti DNR paprastai yra dvigrandė ekstraląstelinė DNR molekulė. Jį sudaro maži fragmentai (50–200 bp) ir didesni fragmentai (21 kb). Be to, jis jau buvo pripažintas patikimu biomarkeriu diagnozuojant prostatos ir krūties vėžį. Ląstelių neturinti DNR daugiausia cirkuliuoja kraujyje kaip nukleosomos. Nukleosomos yra histonų ir DNR branduoliniai kompleksai. Cf DNR galima kiekybiškai įvertinti naudojant įvairius metodus, tokius kaip PGR, masiškai lygiagreti seka, ultravioletinė spektrometrija, PicoGreen dažymas ir ELISA. Kadangi Cf DNR aptikimas kraujyje yra greitas, lengvas, neinvazinis, pasikartojantis metodas, ateityje jis bus galimas biomarkeris diagnozuojant daugybę ligų, tokių kaip autoimuninės reumatinės ligos ir navikai.
Kas yra cirkuliuojančio naviko DNR?
Cirkuliuojantis naviko DNR (CT DNR) yra suskaidyta naviko DNR, kuri cirkuliuoja kraujyje. Jis turi naviko kilmę. Kadangi cirkuliuojantis navikas gali atspindėti visą naviko genomą, jis įgijo didelį trauką dėl galimo naudingumo klinikinėse sistemose. Skystos biopsijos, iš kurių paimamas kraujas, gali būti naudojamos tiriant cirkuliuojančius navikus.
02 pav. Cirkuliuojanti naviko DNR
Biologiniai procesai, kurie gali būti susiję su Ct DNR išskyrimu, yra apoptozė ir nekrozė iš mirštančių ląstelių arba aktyvus išsiskyrimas iš naviko ląstelių. Sveikuose audiniuose infiltruojantys fagocitai gali išvalyti Ct DNR. Be to, analizuojant cirkuliuojančią naviko DNR galima naudoti įvairius metodus, tokius kaip lašelių skaitmeninis PGR, BEAMing, CAPP-Seq (gilusis sekvenavimas), saugus sekos nustatymas ir dvipusis sekos nustatymas.
Kokie yra DNR be ląstelių ir cirkuliuojančio naviko DNR panašumai?
- Ląstelių neturinti DNR ir cirkuliuojančio naviko DNR yra dviejų tipų cirkuliuojančios nukleino rūgštys.
- Jos sudarytos iš nukleotidų.
- Abu tipai gali būti naudojami kaip potencialūs žymenys diagnozuojant įvairias ligas klinikinėse sistemose.
- Jų randama kraujyje.
- Abu yra tarpląstelinės DNR molekulių formos.
- Juos abu išvalo infiltruojantys fagocitai.
Kuo skiriasi DNR be ląstelių ir cirkuliuojančio naviko DNR?
Ląstelių neturinti DNR yra įvairios DNR formos, pvz., cirkuliuojantis naviko DNR, be ląstelių mitochondrijų DNR ir be ląstelių vaisiaus DNR ir kt., kurios laisvai cirkuliuoja kraujyje, o cirkuliuojanti naviko DNR yra fragmentuota iš naviko DNR. kuris cirkuliuoja kraujyje. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp DNR be ląstelių ir cirkuliuojančio naviko DNR. Be to, DNR be ląstelių cirkuliuoja 50–220 bp fragmentais, o cirkuliuojanti naviko DNR cirkuliuoja fragmentais, kurių dydis svyruoja nuo 134 iki 144 bp.
Toliau pateikta infografija pateikia skirtumą tarp DNR be ląstelių ir cirkuliuojančio naviko DNR lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – DNR be ląstelių ir cirkuliuojančio naviko DNR
Cirkuliuojančios nukleorūgštys patenka į kraują reguliuojamais arba atsitiktiniais mechanizmais. Ląstelių neturinti DNR ir cirkuliuojančio naviko DNR yra dviejų tipų cirkuliuojančios nukleino rūgštys. DNR be ląstelių yra įvairios DNR formos, tokios kaip cirkuliuojanti naviko DNR, be ląstelių mitochondrijų DNR, be ląstelių vaisiaus DNR, kurios laisvai cirkuliuoja kraujyje, o cirkuliuojanti naviko DNR yra fragmentuota naviko DNR, kuri cirkuliuoja kraujyje. Taigi, tai apibendrina skirtumą tarp ląstelių neturinčios DNR ir cirkuliuojančio naviko DNR.
