Pagrindinis skirtumas tarp serino ir tirozino rekombinazės yra tas, kad serino rekombinazėje serinas yra nukleofilinė aminorūgštis, kurią fermentas naudoja atakuoti DNR konkrečios vietos rekombinacijos metu, o tirozino rekombinazėje tirozinas yra naudojama nukleofilinė aminorūgštis. fermentas, kad atakuotų DNR vietos specifinės rekombinacijos metu.
Sitespecifinė rekombinacija (konservatyvi vietai būdinga rekombinacija) yra genetinės rekombinacijos technikos tipas, kai DNR grandinės mainai vyksta tarp segmentų, turinčių tam tikrą sekos homologiją. Vietai būdingos rekombinazės reguliuoja vietos specifinį rekombinacijos procesą. Šie fermentai yra sugrupuoti į dvi šeimas kaip serino rekombinazės šeima ir tirozino rekombinazės šeima. Pavadinimai kilę iš konservuotų nukleofilinių aminorūgščių liekanų, esančių pirmiau minėtose dviejose rekombinazių klasėse, kurios naudojamos atakuoti DNR ir kuri kovalentiškai su ja susijungia vykstant sruogų mainams konkrečios vietos rekombinacijos metu.
Kas yra serino rekombinazė?
Taikant specifinės vietos rekombinacijos metodą, dvi trumpos DNR sekos („tikslinės vietos“) supjaustomos tam tikruose abiejų gijų taškuose, o nupjauti galai vėl sujungiami su naujais partneriais. Konkrečiai vietai būdingos rekombinacijos technologijos yra genominės genų inžinerijos priemonės, kurios priklauso nuo rekombinazės fermentų, pakeičiančių tikslinę DNR dalį. Nustatyta, kad daugelis vietos specifinių rekombinacijos sistemų atlieka šiuos DNR pertvarkymus įvairiems tikslams. Tačiau visi šie rekombinazės fermentai priklauso dviem šeimoms. Serino rekombinazė yra viena iš jų. Jie gali tarpininkauti iki trijų tipų DNR pertvarkymams: integracijai, ekscizijai ir inversijai.
01 pav.: Serino rekombinazė
Vietai specifinės rekombinazės, pvz., serino rekombinazės, atlieka DNR pertvarkymą, atpažindamos ir prisijungdamos prie trumpos DNR sekos (tikslinės vietos), kurioje suskaldo DNR stuburą. Vėliau įvyksta dviejų DNR spiralių apsikeitimas ir DNR grandinių susijungimas. Serino rekombinazėje serinas yra aminorūgštis, kurią fermentas naudoja atakuoti DNR vietos specifinės rekombinacijos metu. DNR skilimo metu b altymo-DNR jungtis susidaro per esterifikavimo reakciją. Fosfodiesterio jungtis pakeičiama fosfoserino jungtimi tarp 5'fosfato grupės skilimo vietoje ir konservuotos serino liekanos hidroksilo grupės. Naujasis ryšys kaupia energiją, kuri sunaudojama skaidant DNR tikslinėje vietoje. Vėliau ši energija naudojama DNR sujungimui su atitinkama dezoksiribozės hidroksilo grupe kitoje vietoje. Serino rekombinazių pavyzdžiai yra serino rezolvazės/invertazės ir serino integrazės.
Kas yra tirozino rekombinazė?
Tirozino rekombinazė yra kita fermentų klasė, reguliuojanti konservatyvią vietos specifinę rekombinaciją. Kaip aprašyta anksčiau, tirozino rekombinazė taip pat atlieka DNR pertvarkymą tokiu pačiu būdu, atpažindama ir prisijungdama prie trumpos DNR sekos (tikslinės vietos), kurioje jie suskaido DNR stuburą. Vėliau vyksta dviejų DNR spiralių apsikeitimas ir DNR grandžių sujungimas.
02 pav.: Tirozino rekombinazė
Tačiau tirozino rekombinazėje tirozinas yra aminorūgštis, kurią fermentas naudoja atakuoti DNR konkrečios vietos rekombinacijos metu. Bendras šios klasės bruožas yra konservuota nukleofilinė tirozino liekana, kuri atakuoja skerdenos DNR fosfatą ir sudaro 3′-fosfotirozino jungtį. Tirozino rekombinazės (A1) ir tirozino integrazės (A2) yra svarbiausios fermentų grupės tirozino rekombinazės fermentų šeimoje.
Kokie yra serino ir tirozino rekombinazės panašumai?
- Jie yra rekombinazės fermentų klasė.
- Abu reguliuoja konkrečios vietos rekombinaciją.
- Jie yra b altymai.
- Pagrindinė cheminė reakcija abiem yra vienoda.
- Abu katalizuoja peresterinimo reakcijas.
Kuo skiriasi serinas ir tirozino rekombinazė?
Serino rekombinazėje serinas yra nukleofilinė aminorūgštis, kurią fermentas naudoja atakuoti DNR konkrečios vietos rekombinacijos metu. Kita vertus, tirozino rekombinazėje tirozinas yra nukleofilinė aminorūgštis, kurią fermentas naudoja atakuoti DNR vietos specifinės rekombinacijos metu. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp serino ir tirozino rekombinazės. Bendras serino rekombinazės bruožas yra tas, kad ji sudaro fosfoserino ryšį su DNR, o tirozino rekombinazė sudaro fosfotirozino ryšį su DNR konkrečios vietos rekombinacijos proceso metu.
Toliau pateiktoje infografijoje pateikiami skirtumai tarp serino ir tirozino rekombinazės lentelės pavidalu.
-
Skirtumas tarp serino ir tirozino rekombinazės lentelės pavidalu
Santrauka – serinas prieš tirozino rekombinazę
Rekombinacija gali įvykti tarp panašių DNR molekulių, kaip ir homologų rekombinacijos, arba skirtingų molekulių, kaip ir nehomologų rekombinacijos atveju. Vietos specifinė rekombinacija yra genetinės rekombinacijos rūšis, kai DNR grandinės mainai vyksta tarp segmentų, turinčių bent tam tikrą sekos homologiją. Jį katalizuoja rekombinazės. Dauguma rekombinazių yra sugrupuotos į dvi šeimas: serino rekombinazę ir tirozino rekombinazę. Serino rekombinazė naudoja seriną kaip nukleofilinę aminorūgštį, kad atakuotų DNR konkrečios vietos rekombinacijos proceso metu. Tirozino rekombinazė naudoja tiroziną kaip nukleofilinę aminorūgštį, kad atakuotų DNR konkrečios vietos rekombinacijos proceso metu. Todėl tai yra pagrindinis skirtumas tarp serino ir tirozino rekombinazės.
