Pagrindinis skirtumas tarp oligopeptido ir polipeptido yra tas, kad oligopeptiduose yra nedaug aminorūgščių liekanų, o polipeptiduose yra daug aminorūgščių liekanų.
Sąvokos oligopeptidai ir polipeptidai patenka į b altymų kategoriją. Peptidai yra trumpos aminorūgščių grandinės. Aminorūgštys jungiasi viena su kita per peptidinius ryšius. Todėl šiuos peptidus galime suskirstyti į kategorijas pagal šiuose peptiduose esančių aminorūgščių skaičių. Pvz., dipeptidai, tripeptidai, tetrapeptidai, oligopeptidai ir polipeptidai.
Kas yra oligopeptidas?
Oligopeptidas yra aminorūgščių grandinė, kurios molekulėje yra nedaug aminorūgščių. Šias molekules dažnai vadiname „peptidais“kaip bendrą terminą. Šiose peptidų molekulėse esančių aminorūgščių liekanų skaičius gali svyruoti nuo dviejų iki dvidešimties aminorūgščių. Oligopeptidai taip pat gali apimti kai kurias mažas peptidų formas, pvz., dipeptidus, tripeptidus ir kt. Kai kurie įprasti natūraliai pasitaikančių oligopeptidų pavyzdžiai yra mikroviridinas, cianopeptolinai, mikrocistinai ir kt.
01 pav.: Tripeptido struktūra
Šiuos oligopeptidus gamina neribosominės peptidų sintazės arba NRPS. Tačiau yra keletas išimčių. Pavyzdžiui, ciklamidai ir mikroviridinas sintetinami ribosominiais keliais. Oligopeptidų išskyrimo procesas apima oligopeptidų sodrinimą, gryninimą ir identifikavimą. Identifikavimo procesui galime naudoti gelio chromatografiją, HPLC, HPLC-masių spektroskopiją, jonų mainų chromatografiją ir kt.
Kas yra polipeptidas
Polipeptidas yra aminorūgščių liekanų grandinė, kurioje yra daug aminorūgščių. B altyme yra viena ar daugiau polipeptidinių grandinių. Šiose polipeptidinėse grandinėse aminorūgštys yra sujungtos viena su kita peptidiniais ryšiais, kurie yra kovalentinių cheminių jungčių tipas. Kiekvienoje polipeptidinėje grandinėje yra du galai: N-galas ir C-galas. N-galas yra amino-galas, kuris baigiasi laisva aminogrupe, o C-galas yra karboksilo galas, kuris baigiasi laisva karboksilo grupe. Peptide esančių aminorūgščių seką lemia mRNR kodonai, kurie dalyvauja gaminant polipeptidą arba b altymą, verčiant šablono grandinę.
Pagal polipeptidų skaičių ir išsidėstymą b altyme, yra keturi pagrindiniai b altymų struktūrų tipai:
- Pirminė struktūra – pirminėje b altymo struktūroje yra viena polipeptidinė grandinė, turinti disulfidinius tiltelius tarp kai kurių aminorūgščių toje pačioje grandinėje, todėl struktūra yra sulankstyta.
- Antrinė struktūra – antrinė b altymo struktūra turi dvi pagrindines formas: alfa spiralės struktūrą ir beta lakštinę struktūrą.
02 pav.: Alfa spiralės struktūra
- Tretinė struktūra – tai labai sulankstyta tinklo struktūra. Ši struktūra yra labai svarbi, nes ji lemia b altymo funkciją.
- Ketvirtinė struktūra – tai labai sudėtinga dviejų ar trijų polipeptidinių grandinių, sujungtų viena su kita, struktūra.
Kuo skiriasi oligopeptidas ir polipeptidas?
Oligopeptidai ir polipeptidai yra dvi skirtingos b altymų kategorijos. Jie skiriasi vienas nuo kito priklausomai nuo aminorūgščių liekanų, esančių b altymų molekulėse, skaičiaus. Todėl pagrindinis skirtumas tarp oligopeptido ir polipeptido yra tas, kad oligopeptiduose yra nedaug aminorūgščių liekanų, o polipeptiduose yra daug aminorūgščių liekanų.
Toliau pateiktoje infografijoje apibendrinamas skirtumas tarp oligopeptido ir polipeptido.
Santrauka – oligopeptidas prieš polipeptidą
Oligopeptidai ir polipeptidai yra dvi skirtingos b altymų kategorijos. Jie skiriasi vienas nuo kito, priklausomai nuo aminorūgščių liekanų, esančių šiose b altymų molekulėse, skaičiaus. Tai yra, pagrindinis skirtumas tarp oligopeptido ir polipeptido yra tas, kad oligopeptiduose yra nedaug aminorūgščių liekanų, o polipeptiduose yra daug aminorūgščių liekanų.
