Pagrindinis skirtumas tarp ksileno cianolio ir bromfenolio mėlynojo yra tas, kad 1 % agarozės gelyje ksileno cianolis migruoja lėčiau, o bromfenolio mėlynasis migruoja greičiau.
Ksileno cianolis ir bromfenolio mėlynasis yra svarbūs kaip spalvų žymekliai, kuriuos galima naudoti stebint agarozės gelio elektroforezės ir poliakrilamido gelio elektroforezės procesą.
Kas yra ksileno cianolis?
Ksileno cianolis yra elektroforezinis spalvų žymeklis arba sekantis dažiklis. Tai naudinga stebint agarozės gelio elektroforezės ir poliakrilamido gelio elektroforezės procesą. Kai ši medžiaga sumaišoma su mėginiu, šios medžiagos koncentracija paprastai tampa apie 0.nuo 005% iki 0,03%. Kai kurie sinonimai, kuriuos galime naudoti ksileno cianoliui, yra Acid Blue 147, ksileno cianolis, ksileno cianolis FF, ksileno cianolis FF ir kt.
Šio junginio cheminė formulė yra C25H27N2NaO 6S2 Ksileno cianolio molinė masė yra 538,61 g/mol. Ši medžiaga gali migruoti maždaug 4–5 kilobazių porų DNR fragmentų greičiu 1% agarozės gelyje. Tačiau tai priklauso nuo mūsų naudojamo buferio. Paprastai ksileno cianolis ant 6% poliakrilamido gelio gali migruoti maždaug 140 bazinių porų DNR fragmentų greičiu. Kita vertus, jis gali migruoti 20 % denatūruojančio poliakrilamido gelio elektroforezės metu 25 bazių oligonukleotido greičiu.
Ksileno cianolio vandenilio jungties donorų skaičius yra 2 m, o vandenilio jungties akceptorių skaičius yra 8. Šio junginio sukamųjų jungčių skaičius gali būti 7. Ksileno cianolio sudėtingumas gali būti apibūdinamas kaip 1120 laipsnių. Jo nustatytas jungties stereocentrų skaičius yra 1.
Kas yra bromofenolio mėlynasis?
Bromofenolio mėlynasis yra naudingas pH indikatorius, naudingas kaip elektroforezinis spalvų žymeklis ir dažiklis. Jo cheminis pavadinimas yra 3', 3", 5", 5"-tetrabromfenolsulfonftaleinas, BPB. Cheminė šio junginio formulė yra C19H10Br4O5 S. Šio junginio molinė masė yra 669,96 g/mol. Jis yra bekvapis, o jo tankis gali būti 2,2 g/ml. Jo lydymosi temperatūra yra 273 laipsniai Celsijaus, o virimo temperatūra yra 279 laipsniai Celsijaus. Galime jį paruošti lėtai įpildami bromo perteklių į karštą fenolsulfonftaleino tirpalą ledinėje acto rūgštyje.
Bromofenolio mėlynasis yra naudingas kaip rūgšties ir bazės indikatorius, kai pH yra nuo 3,0 iki 4,6. Jis gali pasikeisti iš geltonos spalvos, kai pH 3,0 iki pH 4,6. Be to, tai yra grįžtama reakcija. Struktūriškai bromfenolio mėlynasis yra panašus į fenolftaleiną.
Be to, galime naudoti jį kaip spalvų žymeklį agarozės gelio elektroforezės ir poliakrilamido gelio elektroforezės procesui stebėti. Ši medžiaga gali turėti neigiamą krūvį esant vidutiniam pH, kur ji gali migruoti ta pačia kryptimi kaip ir DNR ar b altymas gelyje. Migracijos greitis gali skirtis priklausomai nuo gelio tankio ir buferio sudėties. Tačiau tipiškame 1 % agarozės gelyje 1 kartą TAE buferyje arba TBE buferyje ši medžiaga migruoja tokiu pat greičiu kaip ir maždaug 300 bazinių porų DNR fragmentas.
Kuo skiriasi ksileno cianolis ir bromfenolio mėlynasis?
Ksileno cianolis ir bromfenolio mėlynasis yra svarbūs spalvų žymekliai. Pagrindinis skirtumas tarp ksileno cianolio ir bromfenolio mėlynojo yra tas, kad 1 % agarozės gelyje ksileno cianolis migruoja lėčiau, o bromfenolio mėlynasis migruoja greičiau.
Toliau pateikiama ksileno cianolio ir bromfenolio mėlynojo skirtumo santrauka lentelės pavidalu, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – ksileno cianolis vs bromofenolio mėlynasis
Ksileno cianolis ir bromfenolio mėlynasis yra svarbūs kaip spalvų žymekliai, naudojami stebint agarozės gelio elektroforezės ir poliakrilamido gelio elektroforezės procesą. Pagrindinis skirtumas tarp ksileno cianolio ir bromfenolio mėlynojo yra tas, kad 1 % agarozės gelyje ksileno cianolis migruoja lėčiau, o bromfenolio mėlynasis migruoja greičiau.
