Pagrindinis skirtumas tarp ZFN TALEN ir CRISPR yra tas, kad ZFN yra žmogaus sukurta genų redagavimo technika, pagrįsta cinko piršto nukleazėmis, sudarytomis iš cinko piršto domeno ir Fok1 endonukleazės domeno. Tuo tarpu TALEN yra žmogaus sukurta genų redagavimo technika, pagrįsta sulietais b altymais, sudarytais iš bakterinio TALE b altymo ir Fok1 endonukleazės, o CRISPR yra natūralus RNR pagrįstas bakterijų gynybos mechanizmas, kurį skatina dviejų tipų RNR ir susiję Cas b altymai.
Genų redagavimo įrankiai yra pagrįsti sukurtomis nukleazėmis, sudarytomis iš sekai specifinių surišimo domenų ir nespecifinių DNR skilimo modulių. ZFN, TALEN ir CRISPR yra trijų tipų genų redagavimo metodai. ZEN ir TALEN yra žmogaus sukurtos sistemos, o CRISPR yra natūrali bakterijų sistema. Visos trys sistemos atpažįsta sekas ir skaido tikslinę DNR. Cinko pirštų nukleazės susideda iš cinko piršto domeno ir Fok1 endonukleazės. TALEN susideda iš bakterinio TALE b altymo ir Fok1 endonukleazės. CRISPR sudaro dvi RNR (trans-aktyvuojančios crRNR ir vienos kreipiančiosios RNR).
Kas yra ZFN?
ZFN yra genų redagavimo įrankis, pagrįstas cinko pirštų nukleazėmis. Cinko piršto nukleazės yra chimerinės nukleazės, sudarytos iš sekai specifinių DNR surišančių domenų ir nespecifinių DNR skilimo domenų iš FokI restrikcijos endonukleazės. Tai žmogaus sukurta genomo redagavimo technologija, leidžianti atlikti daugybę genų modifikacijų, sukeliant dvigubos grandinės pertraukas DNR.
01 pav.: ZFN
ZFN yra svarbi priemonė nustatant tikslinius augalų ir kelių augalų rūšių pakeitimus. Tai leidžia į augalus įtraukti vertingų savybių. Be to, ZFN turi gydomąjį potencialą, nes gali atlikti tikslią genetinę modifikaciją, kad veiksmingai pašalintų simptomus.
Kas yra TALEN?
Į transkripcijos aktyvatorių panašios nukleazės (TALEN) yra genų redagavimo įrankis, pagrįstas chimerinėmis nukleazėmis, panašiomis į ZFN. Tai taip pat žmogaus sukurta genomo redagavimo technologija. TALEN sukelia genų modifikaciją, sukeldamas dvigubos grandinės pertraukas DNR. TALEN susideda iš sekai specifinių DNR surišančių domenų, sujungtų su nespecifiniu DNR skilimo moduliu. Todėl jis turi FokI skilimo domenus ir DNR surišančius domenus, gautus iš TALE b altymų.
02 pav.: TALEN
TALE b altymai natūraliai randami Xanthomonas bakterijų gentyje. Šiuose b altymuose yra DNR surišančių domenų, sudarytų iš 33–35 aminorūgščių pasikartojančių domenų. Vienas iš pagrindinių TALEN pranašumų, palyginti su ZFN, yra tas, kad DNR surišimo domeno surišimo specifiškumas gali būti pakeistas TALEN modifikuojant 33–34 aminorūgščių pasikartojimus.
Kas yra CRISPR?
CRISPR reiškia Clustered Regulatory Interspaced Short Palindromic Repeats. Tai natūralus RNR pagrįstas gynybos mechanizmas, veikiantis bakterijose. Tiesą sakant, tai yra genomo redagavimo mechanizmas, ypač naudojamas prieš virusus. Virusas arba svetimkūnis gali suaktyvinti šią sistemą bakterijose. CRISPR veikia kartu su su CRISPR susijusiu b altymu (Cas9).
CRISPR susideda iš dviejų RNR: trans-aktyvuojančios crRNR ir vienos kreipiančiosios RNR. Todėl CRISPR atpažinimas priklauso nuo abiejų šių RNR. Kai viruso DNR patenka į bakterijų ląstelę, CRISPR lokusas gamina orientacinę RNR, kuri lydi Cas b altymus, kad pasiektų viruso DNR ir susijungtų su ja ir suskiltų tam tikroje vietoje. Kai viruso DNR suskaidoma, ji tampa neaktyvi dėl patogeninės DNR nutildymo. Taigi CRISPR sistema fiksuoja, skaldo ir inaktyvuoja virusus naudodama Cas b altymus.
03 pav.: CRISPR / Cas9
CRISPR/Cas9 naudojama kaip genomo redagavimo sistema. Tai naujausia technologija. Ši technologija yra labai paprasta, efektyvi ir ekonomiška, palyginti su kitais genomo redagavimo būdais. Palyginti su ZFN ir TALEN, CRISPR/Cas9 sistema yra veiksminga priemonė, skatinanti tikslinius genomo pokyčius.
Kokie yra ZFN TALEN ir CRISPR panašumai?
- ZFN, TALEN ir CRISPR yra genų redagavimo metodai.
- Visos trys priemonės bus daug žadantys metodai, padedantys ištaisyti daugelio ligų genetines priežastis.
- Tačiau jie rodo taikymo apribojimus, netobulą specifiškumą ir taikymą pagal genus.
- Visos trys sistemos gali sukelti dvigubos grandinės pertraukas.
Kuo skiriasi ZFN TALEN ir CRISPR?
ZFN yra genų redagavimo technika, pagrįsta cinko pirštų nukleazėmis, o TALEN yra genų redagavimo technika, pagrįsta sulietais b altymais, sudarytais iš bakterinio TALE b altymo ir Fok1 endonukleazės, o CRISPR yra natūralus RNR pagrįstas bakterijų gynybos mechanizmas, kuris yra varomas. dviejų tipų RNR ir susijusių Cas b altymų. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp ZFN TALEN ir CRISPR.
Toliau pateiktoje infografikoje lentelės pavidalu pateikiami skirtumai tarp ZFN TALEN ir CRISPR, kad būtų galima palyginti.
Santrauka – ZFN vs TALEN vs CRISPR
ZFN, TALEN ir CRISPR yra genų redagavimo technologijos. CRISPR yra naujausia technologija, kuri rodo geresnį efektyvumą, įgyvendinamumą ir daugiafunkcinį klinikinį pritaikymą. Tiek ZFN, tiek TALEN yra dirbtiniai įrankiai, o CRISPR yra bakterijų gynybos mechanizmas. Tiek ZFN, tiek TALEN yra sukurtos nukleazės. CRISPR susideda iš dviejų RNR tipų, susijusių su Cas b altymais. Taigi, tai yra skirtumo tarp ZFN TALEN ir CRISPR santrauka.
