Pagrindinis skirtumas tarp CRISPR ir CRISPR Cas9 yra tas, kad CRISPR (sugrupuotas reguliariai tarpais išdėstytas trumpas palindrominis pasikartojimas) yra natūraliai atsirandantis prokariotų imuninės gynybos mechanizmas, o CRISPR cas9 yra RNR valdoma Cas9 nukleazė, kuri yra CRISPR adaptyviosios sistemos dalis. imuninė sistema.
CRISPR yra antivirusinė gynybinė imuninė sistema, randama bakterijose ir archėjose. Tai DNR sekų šeima, randama bakterijų genome. Jį sudaro tarpinės sekos, gautos iš bakteriofagų, anksčiau juos užkrėstų, DNR fragmentų. Vėlesnėse virusinėse infekcijose bakterijos naudoja šias sekas viruso DNR sunaikinimui. CRISPR sekos turi trumpus palindrominius pasikartojimus ir tarpines sekas. Be to, CRISPR kartotinės tarpinės sekos dažnai turi susijusių genų, koduojančių Cas b altymus. Cas9 yra RNR valdoma endonukleazė. Kartu su CRISPR sekomis Cas9 b altymas veikia kaip adaptyvi imuninė sistema bakterijose prieš bakteriofagus.
Kas yra CRISPR?
CRISPR reiškia Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Tai bakterijų genome randamų DNR sekų sankaupa. Jis veikia kaip natūralus bakterijų gynybos mechanizmas ir pirmą kartą buvo nustatytas E. coli. Bakterijose jis veikia kaip adaptyvi imuninė apsauga, ypač nuo bakteriofagų. Todėl tai yra konkrečios sekos mechanizmas.
01 pav.: CRISPR
CRISPR sistemoje yra keletas trumpai segmentuotų DNR pasikartojančių sekų. Šie pakartojimai yra palindrominiai, turintys tą pačią bazinę seką, kai skaitote nuo 5' iki 3', o kiti pateikia tą pačią seką, kai skaitote nuo 3' iki 5'. Be to, pakartojimai yra identiški. Jie yra tarp trumpų „tarpinių“DNR sekų, kurios nėra identiškos. Tačiau šios tarpinės DNR sekos yra panašios arba atitinka svetimą bakteriofago DNR. Su CRISPR susiję genai yra žinomi kaip CRISPR susiję genai arba Cas genai. Cas genai koduoja Cas b altymus, kurie yra helikazės arba nukleazės. Helikazės išvynioja DNR, o nukleazės supjausto DNR. Apskritai, kalbant apie CRISPR, tai yra bakterijų imuninė sistema, kuri veikia prieš bakteriofagus (bakterijas užkrečiančius virusus).
Kas yra CRISPR Cas9?
Cas9 arba CRISPR susijęs b altymas 9 yra bakterinė RNR valdoma endonukleazė. Todėl tai yra fermentas, kuris atpažįsta ir supjausto tikslinę DNR (ypač bakteriofago DNR), kuri yra komplementari su orientacine RNR. Jis atlieka sruogoms būdingą skilimą. Cas9 b altymą koduoja su CRISPR susijęs genas. CRISPR cas9 yra RNR valdoma CRISPR-Cas9 nukleazės sistema, kuri gali būti naudojama kaip RNR programuojama DNR nukreipimo ir redagavimo platforma genomo redagavimui, transkripcijos perturbacijai, epigenetiniam moduliavimui ir genomo vaizdavimui. Ši CRISPR cas9 sistema yra labai populiari dabartinėse genomo redagavimo sistemose.
02 pav.: CRISPR Cas9
Šiuo metu CRISPR/Cas9 sistema naudojama pakeisti arba modifikuoti žinduolių genomą, taikant transkripcijos slopinimą arba aktyvavimą. Žinduolių ląstelės gali reaguoti į CRISPR / Cas9 tarpininkaujamas DNR pertraukas, taikydamos taisymo mechanizmą. Tai gali būti atliekama naudojant nehomologinį galų sujungimo metodą (NHEJ) arba homologinį taisymą (HDR). Abu šie remonto mechanizmai vyksta įvedant dvigrandžius pertraukas. Tai lemia žinduolių genų redagavimą. NHEJ gali sukelti genų mutacijų abliaciją ir gali būti naudojamas funkcijos praradimui. HDR gali būti naudojamas įvesti specifines taškines mutacijas arba įvesti įvairaus ilgio DNR segmentus. Šiuo metu CRISPR/Cas sistema naudojama terapijos, biomedicinos, žemės ūkio ir mokslinių tyrimų srityse.
Kokie yra CRISPR ir CRISPR Cas9 panašumai?
- Cas9 yra CRISPR Cas sistemos dalis.
- Crisper cas9 sistema yra imuninė sistema, natūraliai randama bakterijose.
Kuo skiriasi CRISPR ir CRISPR Cas9?
CRISPR yra bakterijų genome randamų DNR sekų sankaupa, kuri veikia kaip natūrali apsaugos nuo bakteriofagų sistema. Jį sudaro reguliariai išdėstyti trumpi palindrominiai pasikartojimai, tarpikliai ir susiję genai. Priešingai, cas9 yra su CRISPR susijęs b altymas 9, kuris yra RNR valdomas endonukleazės fermentas. Jis atpažįsta ir suskaido DNR dvigubas virusų grandines. Tiesą sakant, tai yra CRISPR gynybos sistemos dalis. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp CRISPR ir CRISPR cas9.
Santrauka – CRISPR prieš CRISPR Cas9
CRISPR Cas sistema yra mikrobų apsaugos sistema. CRISPR yra DNR sekų grupė, susidedanti iš palindrominių trumpų pasikartojimų, tarpinių sekų ir susijusių genų. Cas9 yra vienas Cas b altymas, kuris yra RNR valdoma endonukleazė. CRISPR ir Cas9 b altymai sukuria imuninę sistemą, kuri veikia prieš bakteriofagų infekcijas bakterijose. Cas9 b altymas gali suskaldyti svetimą viruso DNR ir jas suardyti. CrRNA nukreipia cas9 atpažinti viruso DNR. Todėl CRISPR cas9 sistema yra natūrali imuninė sistema, randama bakterijose prieš virusus. Taigi, tai yra skirtumo tarp CRISPR ir CRISPR cas9 santrauka.
