Pagrindinis skirtumas tarp Watson ir Crick ir Hoogsteen bazių poros yra tas, kad Watson ir Crick bazių poravimas yra standartinis būdas, apibūdinantis bazių porų susidarymą tarp purinų ir pirimidinų. Tuo tarpu Hoogsteen bazių poravimas yra alternatyvus būdas sudaryti bazių poras, kai purinas įgauna kitokią konformaciją pirimidino atžvilgiu.
Nukleotidą sudaro trys komponentai: azoto bazė, pentozės cukrus ir fosfato grupė. DNR ir RNR struktūroje dalyvauja penkios skirtingos azoto bazės ir du pentozės cukrūs. Kai šie nukleotidai sudaro nukleotidų seką, komplementarios bazės, purinai arba pirimidinai, sudaro vandenilinius ryšius tarp jų. Tai žinoma kaip bazinis poravimas. Todėl bazių pora susidaro sujungiant dvi azotines bazes vandeniliniais ryšiais. Watson ir Crick bazių poravimas yra klasikinis arba standartinis metodas, o Hoogsteen bazių poravimas yra alternatyvus būdas sudaryti bazines poras.
Kas yra Watson ir Crick bazės poravimas?
Watson ir Crick bazių poravimas yra standartinis metodas, paaiškinantis azoto bazių poravimą nukleotiduose. Jamesas Watsonas ir Francisas Crickas 1953 m. paaiškino šį bazės atskyrimo metodą, kuris stabilizuoja dvigubo standarto DNR spiralę. Remiantis Watson ir Crick bazių poravimu, adeninas sudaro vandenilinius ryšius su timinu DNR ir su uracilu RNR. Be to, guaninas sudaro vandenilinius ryšius su citozinu tiek DNR, tiek RNR.
01 paveikslas: Watson ir Crick bazių poravimas
Tarp G ir C yra trys vandenilio ryšiai, o tarp A ir T yra du vandenilio ryšiai. Šios bazių poros leidžia DNR spiralei išlaikyti taisyklingą spiralinę struktūrą. Dauguma nukleotidų sekų (60 %) turi Watson ir Crick bazių poras, kurios yra stabilios esant neutraliam pH.
Kas yra Hoogsteen bazės poravimas?
Hoogsteen bazių poravimas yra alternatyvus būdas formuoti bazių poras nukleorūgštyse. Tai pirmą kartą aprašė amerikiečių biochemikas Karstas Hoogsteenas 1963 m. Hoogsteen bazių poros yra panašios į Watson ir Crick bazių poras. Jų yra tarp adenino (A) ir timino (T), guanino (G) ir citozino (C). Tačiau purinas turi skirtingą konformaciją pirimidino atžvilgiu. A ir T bazių poroje adeninas pasukamas 1800 kampu apie glikozidinę jungtį, todėl galima naudoti alternatyvią vandenilio ryšio schemą. Panašiai G ir C poroje guaninas yra pasuktas 180° apie glikozidinę jungtį. Be to, glikozidinių ryšių kampas yra didesnis Hoogsteen bazių porose. Be to, Hoogsteen bazių porų susidarymas nėra stabilus esant neutraliam pH.
02 pav. Watson ir Crick bazių poravimas vs Hoogsteen bazių poravimas
Hoogsteen bazių poros yra nekanoninės bazių poros, dėl kurių nukleotidų sekos yra mažiau stabilios nei standartinės bazių poros. Be to, jie gali sutrikdyti DNR dvigubą spiralę. Nors Hoogsteen bazinių porų pasitaiko natūraliai, jos yra labai retos.
Kokie yra Watson ir Crick ir Hoogsteen bazinių porų panašumai?
- Watson, Crick ir Hoogsteen bazių poravimas yra du būdai apibūdinti bazių porų susidarymą nukleorūgštyse.
- Abu yra natūraliai DNR.
- Be to, jie egzistuoja pusiausvyroje vienas su kitu.
- Bazinės poros abiejuose metoduose yra panašios.
Kuo skiriasi Watson ir Crick bei Hoogsteen bazinis poravimas?
Watson ir Crick bazių poravimas yra standartinis būdas, apibūdinantis bazių porų susidarymą tarp purinų ir pirimidinų. Kita vertus, Hoogsteen bazių poravimas yra alternatyvus būdas sudaryti bazių poras, kuriose purinas įgauna skirtingą konformaciją pirimidino atžvilgiu. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp Watson ir Crick ir Hoogsteen bazinių porų. Watson ir Crick bazių porą aprašė James Watson ir Francis Crick 1953 m., o Hoogsteen bazių porą aprašė Karst Hoogsteen 1963 m. Be to, Watson ir Crick bazių poros yra stabilios, o Hoogsteen bazių poros paprastai yra mažiau stabilios.
Toliau pateikta infografija apibendrina Watson ir Crick ir Hoogsteen bazinių porų skirtumus.
Santrauka – Watson ir Crick vs Hoogsteen bazės poravimas
Watson ir Crick bazių poravimas ir Hoogsteen bazių poravimas yra dviejų tipų būdai, apibūdinantys azoto bazių susidarymą nukleotidų sekose. Hoogsteen bazių poroje purino bazė turi skirtingą konformaciją pirimidino bazės atžvilgiu. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp Watson ir Crick ir Hoogsteen bazinių porų. Be to, Watson ir Crick bazių poros stabilizuoja DNR dvigubą spiralę, o Hoogsteen bazių poros daro spiralę nestabilią. Tačiau abiejų tipų bazinės poros atsiranda natūraliai ir egzistuoja pusiausvyroje viena su kita.
