Pagrindinis skirtumas tarp Rho priklausomo ir Rho nepriklausomo užbaigimo yra tas, kad nuo Rho priklausomo nutraukimo atveju Rho faktorius jungiasi su transkriptu ir nutraukia transkripciją nutraukdamas vandenilio ryšius tarp šablono ir nuorašo, o nepriklausomas Rho užbaigimas užbaigia transkripciją sukuriant plaukų segtuko kilpos struktūrą ir U turtingą sritį nuoraše.
Transkripcija yra vienas iš dviejų genų ekspresijos etapų. Tai procesas, kurio metu iš genetinės informacijos, paslėptos geno DNR sekoje, susidaro mRNR seka. Transkripcija vyksta trimis etapais: inicijavimas, pailgėjimas ir užbaigimas. RNR polimerazės fermentas prisijungia prie geno promotoriaus sekos ir pradeda katalizuoti RNR grandinės sintezę. Kol nerandama terminatoriaus seka, RNR polimerazė prideda nukleotidų ir sukuria RNR grandinę. Prokariotuose nutraukimas vyksta naudojant dvi pagrindines nutraukimo strategijas: nuo Rho priklausomą nutraukimą ir Rho nepriklausomą nutraukimą. Rho faktorius yra b altymas, pasižymintis helikazės aktyvumu.
Kas yra Rho priklausomybės nutraukimas?
Rho priklausomas nutraukimas yra vienas iš dviejų transkripcijos nutraukimo strategijų tipų, atsirandančių prokariotuose. Rho faktorius yra b altymas, pasižymintis helikazės aktyvumu.
01 pav.: Nutraukimas nuo Rho priklausomybės
Rho b altymas jungiasi su RNR transkriptu ir juda išilgai RNR polimerazės 5’-3’ kryptimi, skatindamas vandenilinių ryšių tarp DNR šablono ir RNR transkripto atsiskyrimą. Kai Rho faktorius pasiekia transkripcijos burbulą, jis išskiria DNR/RNR hibridą ir atpalaiduoja nuorašą iš transkripcijos burbulo. Kai taip nutinka, transkripcija nutraukiama.
Kas yra Rho nepriklausomas nutraukimas?
Rho nepriklausomas nutraukimas yra antroji strategija, kuri nutraukia prokariotų transkripciją. Paprastai terminatoriaus sritis turi apverstą pasikartojimo seką. Iškart po apverstos kartojimo sekos yra adenino turtingas regionas (AAAA). Kai RNR polimerazė juda į priekį, ji sukuria mRNR seką. Kadangi dvi sritys yra viena kitą papildančios apverstos kartojimo sekos srityje, dėl vandenilio ryšio susidaro plaukų segtuko kilpos struktūra. Kitas regionas bus U turtingas regionas. Plaukų segtuko struktūra sustabdo RNR polimerazės aktyvumą.
02 pav. Rho nepriklausomas nutraukimas
Be to, U turtinguose regionuose yra silpna transkripto U bazių ir šablono A bazių sąveika. Šie silpni adenino ir uracilo ryšiai destabilizuoja DNR šabloną ir RNR transkriptą ir atskiria vienas kitą. Galiausiai nuorašas išlaisvinamas iš transkripcijos vietos.
Kokie yra Rho priklausomo ir nepriklausomo Rho nutraukimo panašumai?
- Rho priklausomas ir Rho nepriklausomas nutraukimas yra dvi pagrindinės nutraukimo strategijos, aptinkamos prokariotuose.
- Abi formos išleidžia nuorašą iš DNR šablono, kad nutrauktų transkripciją.
Kuo skiriasi Rho priklausomas ir nepriklausomas Rho nutraukimas?
Nuo Rho priklausomą pabaigą tarpininkauja Rho b altymas, o nepriklausomas Rho nutraukimas vyksta susidarant plaukų segtuko kilpos struktūrai. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp Rho priklausomo ir nepriklausomo Rho nutraukimo. Be to, Rho b altymas naudoja ATP energiją, o nepriklausomas Rho nutraukimas neapima Rho b altymo ir nenaudoja ATP energijos. Todėl tai taip pat yra reikšmingas skirtumas tarp Rho priklausomo ir nepriklausomo Rho užbaigimo.
Toliau pateiktoje infografikoje parodyta daugiau palyginimų, susijusių su skirtumu tarp Rho priklausomo ir nepriklausomo užbaigimo.
Santrauka – Rho priklausomas prieš Rho nepriklausomą nutraukimą
Rho priklausomas ir Rho nepriklausomas nutraukimas yra du pagrindiniai transkripcijos nutraukimo mechanizmai, atsirandantys prokariotuose. Rho b altymas yra atsakingas už transkripcijos nutraukimą nuo Rho priklausomo nutraukimo. Priešingai, Rho nepriklausomas nutraukimas įvyksta formuojant plaukų segtuko kilpos struktūrą. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp Rho priklausomo ir Rho nepriklausomo užbaigimo.
