Pagrindinis skirtumas tarp Cosmid ir Phagemid yra juose esančių sekų tipas. Kosmidas turi cos vietą ir plazmidę. Todėl tai yra hibridinis vektorius, o Phagemid yra plazmidė, kurioje yra F1 fago replikacijos pradžia.
Kosmidai ir fagemidai naudojami klonavimui, ypač didesniems DNR fragmentams klonuoti. Jie plačiai naudojami, ypač klonuojant genus, atsakingus už įvairių b altymų gamybą. Kosmidai ir fagemidai yra dauginami atskirai kaip plazmidės arba supakuoti į virusines daleles ir tada dauginami.
Kas yra kosmidas?
A Kosmidas, vadinamas hibridine plazmide, apima cos vietas, išskirtas iš lambda fago dalelių, ir plazmidės. Šios cos vietos yra ilgi DNR fragmentai, turintys 200 bazinių porų. Vadinasi, jie turi darnius arba lipnius galus, leidžiančius plazmidei tilpti į viruso DNR. Todėl cos vietos yra gyvybiškai svarbios DNR pakavimui.
Yra trys cos svetainės;
- cosN vieta – dalyvauja DNR grandinės įtrūkime dėl terminazės veiklos
- cosB svetainė – užsiima terminalo laikymu.
- cosQ vieta – dalyvauja užkertant kelią DNR skilimui Dnazių.
01 pav.: Kosmidas
Be to, kosmidai gali replikuoti viengrandę arba dvigrandę DNR, naudodami tinkamą replikacijos pradžią. Kosmiduose paprastai yra atsparumo antibiotikams genų kaip transformantų atrankos žymenų. Taigi, naudojant kosmidą kaip vektorių, galima palengvinti klonavimą, o vektoriaus virškinimas restrikcijos fermentu gali išgauti šiuos fragmentus.
Kas yra fagemidė (phasmid)?
Phagemid, dar vadinamas Phasmid, taip pat yra hibridinio vektoriaus tipas. Fagemidėje yra speciali replikacijos pradžia, vadinama f1 replikacijos pradžia. F1 replikacijos pradžia iš f1 fago.
Phagemid gali replikuoti tiek viengrandę, tiek dvigrandę DNR. Replikacija gali vykti kaip plazmidė, kai vyksta nepriklausoma replikacija, arba gali būti supakuota į fago daleles ir galiausiai užkrėsti bakterinę šeimininkę E coli. Infekuojant E coli ląsteles, f1 fagas reikalauja, kad būtų pilusas. Vadinasi, lyties pilis yra svarbūs fagemidų pakavimo in vitro metu.
Kokie yra Cosmid ir Phagemid panašumai?
- Tiek Cosmid, tiek Phagemid yra klonavimo vektoriai, naudojami rekombinantinėje DNR technologijoje.
- Cosmid ir Phagemid gali replikuoti viengrandę ir dvigrandę DNR.
- Abu gali atlikti nepriklausomą replikaciją, panašią į plazmides.
- Cosmid ir Phagemid gali būti pakuojami in vitro ir užkrėsti bakterijų ląsteles.
- Tiek Cosmid, tiek Phagemid reikalauja tinkamos replikacijos pradžios klonavimui.
Kuo skiriasi Cosmid ir Phagemid?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid yra hibridinis vektorius, kuriame yra cos vieta ir plazmidė. | Phagemid yra plazmidė, kurioje yra F1 fago replikacijos pradžia. |
| Cos svetainių buvimas | |
| Cos vietos yra kosmide ir yra būtinos pakavimui in vitro. | Cos svetainių phagemid nėra. |
| F1 replikacijos kilmės buvimas | |
| Kosmidyje gali būti arba nebūti replikacijos pradžios. | F1 replikacijos pradžia yra fagemidėje. |
| Antibiotikams atsparių genų buvimas | |
| Kosmiduose yra antibiotikams atsparių genų, skirtų identifikuoti transformantus nuo netransformantų. | Fagemidėse nėra antibiotikams atsparių genų. |
| In vitro pakuotės reikalavimas | |
| Reikia cos svetainės. | Reikalingas seksas. |
Santrauka – Cosmid vs Phagemid
Cosmid ir Phagemid yra klonavimo vektoriai, naudojami rekombinantinės DNR technologijoje. Kosmidai yra hibridiniai vektoriai, turintys specialių lipnių galų, vadinamų cos vietomis. in vitro pakavimui reikalingos šios cos svetainės. Nors fagemidai yra plazmidės, kuriose yra f1 replikacijos pradžia, išgauta iš f1 fago. Tiek kosmidas, tiek fagemidas gali būti nepriklausomi replikacijos arba in vitro pakuotės į bakterijų ląsteles. Tai yra svarbūs kosmido ir fagemido skirtumai.
