Pagrindinis skirtumas – minipalydovas ir mikropalydovas
Pasikartojanti DNR yra nukleotidų sekos, kurios organizmų genome kartojasi nuolat. Pasikartojanti DNR sudaro didelę genominės DNR dalį, ir yra trys pagrindiniai tipai, vadinami tandeminiais pasikartojimais, galutiniais pasikartojimais ir tarpiniais pasikartojimais. Tandeminiai pasikartojimai yra labai pasikartojančios sekos, kurios be pertrūkių yra greta viena kitos. Stuburinių gyvūnų genome yra trys pagrindiniai tandeminių pasikartojimų tipai. Tai yra palydovinė DNR, mikrosatelitinė DNR ir minipalydovinė DNR. Minisatelitas yra labai pasikartojančios DNR dalis, kurią sudaro pasikartojančios sekos, sudarytos iš 10–100 bazinių porų, serija. Mikrosatelitas yra pasikartojančios DNR dalis, kurią sudaro trumpos pasikartojančios sekos, sudarytos iš 1–9 bazių porų. Todėl pagrindinis skirtumas tarp minipalydovo ir mikropalydovo yra pasikartojančios sekos dydis arba ilgis.
Kas yra minipalydovas?
Minisatelitinė DNR yra DNR dalis, kurią sudaro trumpos DNR kartojasi sekos, kurių ilgis yra nuo 10 iki 60 bazinių porų. Minipalydovai taip pat vadinami kintamo skaičiaus tandemo kartojimu (VNTR). Minipalydovai dažnai painiojami su mikropalydovais. Tačiau dabar mokslininkai mini palydovus ir mikropalydovus skiria pagal pasikartojančios sekos dydį.
Minisatelitus galima pamatyti daugiau nei 1000 žmogaus genomo vietų. Šiose trumpose sekose gausu G ir C. Pakartojimų skaičius tam tikrame minipalydovėje labai skiriasi tarp individų.
Pirmąjį žmogaus minipalydovą 1980 m. nustatė A. R. Wymanas ir R. White'as. Vėliau Alecas Jeffreysas atrado ekstremalų minipalydovų kopijų skaičiaus polimorfizmą tarp organizmų. Dėl šių atradimų minipalydovai tapo idealiais žymekliais DNR pirštų atspaudams, ryšių analizei ir populiacijos tyrimams. Minisatelitai taip pat prisideda prie genų ekspresijos reguliavimo, transkripcijos, alternatyvaus sujungimo ir kt.
Kas yra mikropalydovas?
Mikrosatelitas yra DNR dalis, kurioje yra paprasti 1–10 bazinių porų ilgio sekos pasikartojimai. Mikropalydovai taip pat vadinami trumpų sekų pakartojimais (SSR) arba paprastais tandeminiais pakartojimais (STR). Yra dviejų tipų mikropalydovai, vadinami paprastais mikrosatelitais ir sudėtiniais mikropalydovais. Paprasti mikropalydovai susideda tik iš vieno tipo pasikartojančių sekų. Sudėtiniai mikropalydovai susideda iš daugiau nei vieno tipo pasikartojimų. Mikropalydovai dažniausiai turi poli A/T sritis. Mikrosatelitai yra kodominuojantys ir gausūs eukariotų genomuose.
Panašiai kaip minipalydovai, mikropalydovai taip pat rodo individų polimorfizmą. Tam tikro mikrosatellito pakartojimų skaičius skirtingiems asmenims skiriasi. Todėl mikrosatelitai taip pat gali būti naudojami kaip genetiniai žymenys imant DNR pirštų atspaudus. Mikrosatelito polimorfizmą galima lengvai nustatyti naudojant PGR ir gelio elektroforezę. Šoninis mikrosatelito regionas yra labai išsaugotas giminingose rūšyse.
Kokie yra minipalydovo ir mikropalydovo panašumai?
- Mini palydovai ir mikropalydovai yra nekoduojančios DNR sekos.
- Abu kartojasi kartu.
- Abu susideda iš labai pasikartojančių sekų.
- Abu gali būti naudojami kaip galingi genetiniai žymenys DNR pirštų atspaudams imti.
Kuo skiriasi minipalydovas ir mikropalydovas?
minipalydovas prieš mikropalydovą |
|
| Minisatelitai yra tandeminiai pasikartojimai, kurių monomero pasikartojimo ilgis yra nuo 10 iki 100 bazinių porų. | Mikropalydovai yra trumpi tandeminiai pasikartojimai, susidedantys iš 1–9 bazinių porų monomerų pasikartojančių sekų. |
| Pasikartojančios sekos dydis | |
| Minisatelite pasikartoja 10–100 bazinių porų sekos. | Mikrosatelitas turi trumpas sekas nuo 1 iki 9 bazinių porų. |
| Bendrosios bazės | |
| Minizateliuose gausu G ir C bazių. | Mikropalydovuose gausu A ir T bazių. |
| Kiti vardai | |
| Minizateliniai palydovai taip pat žinomi kaip kintamo skaičiaus tandemo kartojimas (VNTR). | Mikropalydovai taip pat žinomi kaip trumpos sekos kartojimas (SSR) arba paprastas tandeminis kartojimas (STR). |
Santrauka – minipalydovas prieš mikropalydovą
Minisatelitas ir mikropalydovas yra dviejų tipų tandeminiai pasikartojimai. Jie išskiriami pagal pasikartojančios sekos bazių skaičių arba sekos dydį. Minisatelitas turi nuo 10 iki 100 bazinių porų ilgio pasikartojančią seką, o mikrosatelitas turi nuo 1 iki 9 bazinių porų ilgio pasikartojančią seką. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp minipalydovo ir mikropalydovo. Pasikartojančių sekų kopijų skaičius mini palydovuose ir mikrosatellituose labai skiriasi tarp asmenų. Tiek minipalydovai, tiek mikropalydovai yra galingi DNR žymenys, skirti analizuoti genetinę variaciją rūšių populiacijose ir tarp jų.
Atsisiųsti PDF versiją Minisatellite vs Microsatellite
Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungus, kaip nurodyta citatų pastabose. Atsisiųskite PDF versiją čia. Skirtumas tarp minipalydovo ir mikropalydovo.
