Pagrindinis skirtumas tarp kandidato geno ir GWAS yra tas, kad kandidato genų metodas tiria genetinę variaciją keliuose iš anksto nurodytų dominančių genų skaičiuje, o GWAS tiria visą genomą dėl bendros genetinės variacijos, susijusios su tam tikra liga.
Kandidatų genų metodas ir genomo masto asociacijos tyrimai (GWAS) yra du metodai, svarbūs nustatant genetinį jautrumą ligoms. Kandidato genų metodas yra pagrįstas iš anksto nurodytu nedideliu genų skaičiumi, o GWAS yra pagrįstas viso genomo testavimu. Taigi, kandidato į geną metodui reikia išankstinių žinių apie genus, susijusius su liga, skirtingai nei GWAS.
Kas yra kandidatas genas?
Kandidato genų metodas yra vienas iš metodų, tiriančių ryšį tarp genetinės variacijos iš anksto nurodytuose genuose ir fenotipų ar ligos būsenų. Taikant šį metodą, būtina turėti išankstinių žinių apie geno biologinį funkcinį poveikį aptariamam požymiui ar ligai. Remiantis šiomis žiniomis, atrenkamas nedidelis genų skaičius ir išanalizuojama dėl genetinės variacijos.
01 paveikslas: kandidato į genų metodas
Genų parinkimas atliekamas atsižvelgiant į biologinę, fiziologinę ir funkcinę reikšmę aptariamai ligai. Šis metodas dažnai kuriamas kaip atvejo kontrolės tyrimas.
Kas yra GWAS?
GWAS reiškia Genome-Wide Association Study. Tai taip pat reiškia viso genomo asociacijos tyrimus. Šiuose tyrimuose daugiausia dėmesio skiriama stebėjimo tyrimams. Jie analizuoja skirtingų individų genetinius variantus, paprastai susijusius su konkrečiu bruožu. Visas genomas yra svarbus GWAS analizei.
GWAS yra svarbi priemonė analizuojant vieno nukleotido polimorfizmus, susijusius su įvairiomis ligomis. Tai yra lyginamasis skirtingų vieno nukleotido polimorfizmų tyrimas įvairiose populiacijose. GWAS tyrimo imtis yra labai didelė; taigi jis taip pat yra skerspjūvio kohortos tyrimo formatas.
02 pav.: GWAS
Pirmasis GWAS tyrimas buvo atliktas atsižvelgiant į miokardo infarktą ir analizuojant su miokardo infarktu susijusius genus. Šiuo metu GWAS vaidina svarbų vaidmenį nustatant sudėtingų nežinomos etiologijos ligų genetinį foną.
Kokie yra kandidato geno ir GWAS panašumai?
- Tiek kandidato į geną metodas, tiek GWAS yra metodai, analizuojantys genetinį ryšį tarp genotipo ir ligos fenotipo.
- Abu metodai padeda suprasti genetinį polinkio į ligas pagrindą.
Kuo skiriasi kandidato genas ir GWAS?
Kandidatų genų metodas yra pagrįstas kandidatų genais arba iš anksto nurodytais genais, o GWAS yra pagrįstas visu genomu. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp kandidato geno ir GWAS. Be to, taikant kandidato genų metodą, genų atranka yra būtina, kol to nereikia GWAS.
Be to, norint taikyti kandidato genų metodą, reikia išankstinių žinių apie genus, susijusius su liga, o tai nėra būtina GWAS.
Toliau infografijoje pateikiamas išsamesnis palyginimas, susijęs su kandidato geno ir GWAS skirtumu.
Santrauka – kandidatas Gene prieš GWAS
Kandidatinis genas ir GWAS yra du genų asociacijos tyrimai. Kandidato genų metodas sutelktas į genetinę variaciją, susijusią su liga, esant nedaugeliui iš anksto nustatytų genų. Priešingai, GWAS tiria genetinę variaciją, susijusią su liga visame genome. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp kandidato geno ir GWAS. Abu metodai yra svarbūs norint suprasti genetinį polinkio į ligas pagrindą.
