Pagrindinis skirtumas tarp motyvo ir domeno yra tas, kad motyvas nėra nepriklausomai stabilus, o domenas yra nepriklausomai stabilus.
B altymai yra svarbios mūsų organizme esančios biologinės makromolekulės. Kita vertus, genetinis geno kodas nulems b altymo aminorūgščių seką. Be to, b altymai turi pirminę, antrinę ir tretinę struktūrą. Pirminė struktūra yra polipeptidinės grandinės aminorūgščių seka. Kai polipeptidinės grandinės susilanksto viena su kita, susidaro antrinė b altymo struktūra. Alfa spiralės, beta lakštai ir superantrinės struktūros priklauso antrinėms struktūroms. Tam tikros superantrinių elementų grupės yra žinomos kaip b altymų motyvai. Tretinė b altymo struktūra reiškia jo trimatę struktūrą, kuri lemia b altymo funkciją. Domenas yra sulankstyta b altymo molekulės dalis, kuri yra rutuliška ir atlieka atskirą funkciją. Tai pagrindinė funkcinė ir trimatė b altymo struktūra.
Kas yra motyvas?
Motyvas yra tam tikra super antrinių b altymų elementų, tokių kaip alfa spiralės ir beta struktūros, grupė. Jie yra tam tikri modeliai, esantys skirtinguose b altymuose. Motyvai apibūdina antrinių konstrukcinių elementų lankstymo raštus ir jų sąveiką. Šie lankstymo modeliai stabilizuojasi panašiais ryšiais, kurie yra tretinėse struktūrose. Tačiau jos nėra tokios sudėtingos kaip tretinės struktūros.
01 pav.: Motyvas
Jie yra paprasti antrinių b altymų struktūrų deriniai. Motyvas pats savaime nėra stabilus. Be to, motyvai paaiškina b altymo struktūrą, bet nenumato b altymo funkcijos. B altymų motyvų pavyzdžiai yra beta-alfa-beta motyvas, graikiško rakto motyvas, beta statinė, beta-vingiavimo motyvas ir kt.
Kas yra domenas?
Domenas yra pagrindinis, funkcinis ir trimatis b altymo vienetas. Jis atlieka tam tikrą funkciją. Vienas b altymas gali turėti keletą skirtingų domenų. Kiekvienas domenas yra nepriklausomas vienetas. Tai rutulinė struktūra. Ji yra atsakinga už tam tikrą funkciją arba sąveiką. Domenai gali būti naudojami norint iškelti hipotezę apie neapibūdinto b altymo funkciją. Analizuojant b altymą, būtina atsižvelgti į tai, nes domenai yra funkciniai b altymo vienetai.
02 paveikslas: trys skirtingi piruvato kinazės domenai
Domenai yra labai stabilios ir kompaktiškos struktūros. Juos galima lengvai atskirti nuo kitų regionų. Piruvato kinazė turi tris skirtingus domenus, kaip parodyta 02 paveiksle. Domeno ilgis gali skirtis, o vidutinis ilgis yra 100 aminorūgščių. Kiekviename domene yra hidrofobinė šerdis, sukurta iš antrinių struktūrinių vienetų. Keli domenai kartu sudaro tretinę b altymo struktūrą.
Kokie yra motyvo ir domeno panašumai?
- Motyvas ir domenas yra vienetai, esantys pačiose b altymų molekulėse.
- Jie naudingi klasifikuojant b altymų šeimas.
Kuo skiriasi motyvas ir domenas?
Motyvas yra tam tikra super antrinių b altymų elementų, tokių kaip alfa spiralės ir beta struktūros, grupė, o domenas yra funkcinis b altymo vienetas. Be to, motyvas yra antrinė struktūra, o domenas yra atsakingas už tretinę b altymo struktūrą. Be to, domenas yra nepriklausomas vienetas, skirtingai nei motyvas. Be to, domenas vaizduoja b altymo funkciją, o motyvas ne. Tai yra pagrindiniai motyvo ir srities skirtumai. Žemiau esančioje infografikoje lentelės pavidalu pateikiamas skirtumas tarp motyvo ir domeno.
Santrauka – motyvas prieš domeną
Motyvas yra antrinių b altymų molekulės struktūrų išdėstymas. Paprastai jis pats savaime nėra stabilus, skirtingai nei domenas. Domenas yra nepriklausomai stabili b altymo struktūra. Todėl tai gali būti dalis arba visa b altymo molekulė. Tai trijų matmenų pagrindinis funkcinis b altymo vienetas. Be to, jis turi funkciją ir yra nepriklausomas vienetas. Motyvas gali būti domeno dalis. Tačiau domenas negali būti motyvo dalis. Tai yra skirtumas tarp motyvo ir domeno.
