Pagrindinis skirtumas tarp TATA ir CAAT dėžutės yra tas, kad TATA dėžutė yra konservuota nukleotidų sritis, turinti TATAWAW konsensuso seką, o CAAT dėžutė yra konservuota nukleotidų sritis su konsensuso seka GGCCAATCT.
TATA dėžutė ir CAAT dėžutė yra dvi nukleotidų sritys, turinčios įtakos eukariotų genų transkripcijai. Tai nekoduojančios DNR sekos, randamos prieš transkripcijos inicijavimo vietą. Tiesą sakant, jie randami reguliavimo regione, kuris yra žinomas kaip promotorius. Tiek TATA, tiek CAAT dėžutė yra atsakingos už transkripcijos efektyvumą. Tai yra konsensuso sekos, kurios nepasikeitė per visą evoliucijos procesą.
Kas yra TATA Box?
TATA dėžutė arba Goldberg-Hogness dėžutė yra konsensuso seka, randama eukariotų genų promotoriaus srityje. TATA dėžutė yra pagrindinis promotoriaus elementas. Jis yra 25 bazių poros prieš transkripcijos inicijavimo vietą. Jis išsaugomas viso evoliucijos proceso metu. TATA dėžutės konsensuso seka yra TATAWAW, kur W yra A arba T. Tai nekoduojanti DNR seka. Tačiau TATA dėžutė yra svarbi geno transkripcijai. Tai yra TATA surišančio b altymo (TBP) ir kitų transkripcijos faktorių surišimo vieta. Kai jie prisijungia prie TATA dėžutės, eukariotų genuose vyksta RNR polimerazės II įdarbinimas ir tinkamas transkripcijos reguliavimas.
01 pav.: TATA dėžutė
Kadangi TATA dėžutė dalyvauja reguliuojant transkripciją, TATA dėžutės mutacijos gali sukelti fenotipinius pokyčius, sukeliančius tokias ligas kaip skrandžio vėžys, nugaros smegenų ataksija, Hantingtono liga, aklumas, β-talasemija, imunosupresija, Gilberto sindromas, ir ŽIV-1 ir kt.
Kas yra CAAT Box?
CAAT dėžutė yra nukleotidų sritis su konsensusine GGCCAATCT seka. Panašiai kaip TATA dėžutė, CAAT dėžutė taip pat yra geno promotoriaus srityje. Todėl jis yra maždaug 75–80 bazinių porų prieš transkripcijos vietą.
02 pav.: CAAT dėžutė
Konkretūs transkripcijos faktoriai prisijungia prie CAAT dėžutės. Šis surišimas stabilizuoja išankstinį inicijavimo kompleksą, kad būtų lengviau prisijungti prie fermento RNR polimerazės. Taip pat CAAT dėžutė veikia kaip reguliavimo seka. Mutacijos CAAT dėžutės srityje labai veikia promotoriaus atsaką ir transkripcijos reguliavimą.
Kokie yra TATA ir CAAT Box panašumai?
- TATA ir CAAT yra dvi nukleotidų sritys, esančios eukariotų genų reguliavimo sekoje.
- Jie randami prieš transkripcijos inicijavimo svetainę.
- Abi yra konsensuso DNR sekos.
- Jie yra būtini transkripcijai reguliuoti, todėl tai yra reguliavimo sekos.
Kuo skiriasi TATA ir CAAT Box?
TATA dėžutė yra konservuota nukleotidų sritis, rasta apie 25–30 bazių porų prieš transkripcijos inicijavimo vietą. Kita vertus, CAAT dėžutė yra konservuota nukleotidų sritis, rasta maždaug 75–80 bazių porų prieš transkripcijos inicijavimo vietą. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp TATA ir CAAT dėžės. Be to, TATA dėžutė turi TATAWAW konsensuso seką, o GGCCAATCT yra CAAT dėžutės konsensuso seka.
Be to, kitas reikšmingas skirtumas tarp TATA ir CAAT dėžutės yra tas, kad TATA dėžutė yra TBP ir transkripcijos faktorių surišimo vieta ir dalyvauja transkripcijos reguliavime, o CAAT dėžutė signalizuoja apie RNR transkripcijos faktoriaus surišimo vietą.
Toliau infografijoje apibendrinami skirtumai tarp TATA ir CAAT dėžučių.
Santrauka – TATA vs CAAT Box
TATA dėžutė ir CAAT dėžutė yra dvi konservuoto eukariotų genų promotorių regiono dalys. Jie yra prieš transkripcijos inicijavimo vietą. Abu daro įtaką genų transkripcijai, suteikdami vietas surišti TATA surišančius b altymus ir transkripcijos inicijavimo veiksnius. TATA dėžutė yra 25–35 bazių porų prieš transkripcijos inicijavimo vietą, o CAAT dėžutė yra 75–80 bazinių porų prieš transkripcijos inicijavimo vietą. TATA dėžutės sutarimo seka yra TATAWAW, o CAAT dėžutės konsensuso seka yra GGCCAATCT. Taigi, tai yra skirtumo tarp TATA ir CAAT langelių santrauka.
