Pagrindinis skirtumas tarp konservuotos ir konsensusinės sekos yra tas, kad konservuota seka reiškia panašias nukleorūgščių arba aminorūgščių sekas, kurios pasitaiko skirtingose arba tose pačiose rūšyse per kartas, o konsensuso seka yra dažniausiai pasitaikanti nukleotidų seka arba rasta aminorūgščių seka. labai konservuotame DNR, RNR arba b altymo regione.
Organizmai turi panašių ir skirtingų savybių. Tiriant ryšius tarp organizmų ir juos klasifikuojant, labai svarbus yra organizmų genomas arba genetinė sandara. Yra keletas nukleotidų arba aminorūgščių sekos, kurios yra bendros tarp skirtingų organizmų. Konservuota seka yra nukleino rūgšties arba aminorūgščių seka, kuri atitinka rūšis. Todėl jie yra filogenetiškai svarbūs formuojant filogenetinius medžius. Konservuotose sekose yra specifinės nukleotidų sekos, kurios dažniausiai randamos. Jos žinomos kaip konsensuso sekos.
Kas yra išsaugota seka?
Konservuota seka yra nukleorūgščių seka arba aminorūgščių seka, kuri yra panaši tarp rūšių. Todėl jis yra nuoseklus visose rūšyse evoliucijos metu. Paprastai šias sekas palaiko natūrali atranka. Jie lieka nepakitę toli filogenetiniame medyje. Taigi konservuotos sekos yra svarbios kuriant filogenetinius medžius. Manoma, kad labai konservuotos sekos dažnai turi svarbią funkcinę vertę. Jie taip pat naudingi nustatant genetines ligas. Tačiau konservuotos sekos gali būti koduojančios arba nekoduojančios nukleorūgščių sekos. Be to, konservuotos sekos rodo lėtesnį mutacijų greitį. Vadinasi, jų sudėtis keičiasi labai minimaliai; kartais jie nerodo pokyčių visose kartose.
01 pav.: Konservuota seka
Ribosomų RNR komponentų yra visose gyvenimo srityse, homeobokso sekos eukariotuose ir tmRNR bakterijose yra keli labai konservuotų sekų pavyzdžiai. Konservuotų sekų identifikavimas yra lengvas, kai naudojami bioinformatikos metodai, ypač sekos derinimo įrankis. Be to, kelių sekų derinimas palengvina konservuotų sekų vizualizavimą.
Kas yra konsensuso seka?
Konsensuso seka yra seka, kuri paprastai randama tam tikrame konservuotame DNR arba RNR regione. Tai labai specifinė nukleotidų seka. Pavyzdžiui, E. coli promotoriuose, kurie yra labai konservuotos sekos, yra konsensuso seka ties -10 kaip TATAAT (Pribnow dėžutė). Panašiai yra ir kita konsensuso seka: TTGACA E. coli promotoriuose ties -35 taip pat. Konsensuso sekos taip pat žinomos kaip „dėžės“.
02 pav. Sutarimo seka
Be DNR ir RNR, b altymai taip pat turi konsensuso aminorūgščių sekas. B altymų surišimo vietos dažnai vaizduojamos konsensuso sekomis. Restrikcijos fermentai taip pat turi konsensuso sekas. Be to, sujungimo vietos taip pat yra konsensuso sekos. Panašiai kaip ir konservuotas sekas, konsensuso sekas galima apskaičiuoti ir vizualizuoti naudojant bioinformatikos priemones.
Kokie yra konservuotos ir konsensuso sekos panašumai?
- Konservuotos ir konsensuso sekos yra nukleino rūgščių arba aminorūgščių sekos, kurios būdingos visoms rūšims.
- Ir konservuotas, ir sutarimo sekas gali būti vizualizuojamos naudojant bioinformatikos priemones.
- Jie plačiai naudojami molekulinėje biologijoje.
Kuo skiriasi išsaugota ir konsensuso seka?
Konservuota seka yra nukleorūgšties arba aminorūgščių seka, kuri atitinka rūšis, o konsensuso sekos yra labai specifinės ir dažniausiai randamos bazės arba aminorūgštys tam tikrame konservuotame regione. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp konservuotos ir konsensuso sekos. Be to, kitas skirtumas tarp konservuotos ir konsensuso sekos yra tas, kad konservuotos sekos yra filogenetiškai svarbios, o konsensuso sekos dažnai yra b altymų surišimo vietos, sujungimo vietos, restrikcijos fermentų pjovimo vietos ir tt
Santrauka – Konservuota prieš konsensusą seka
Konservuotos sekos yra nukleorūgščių arba b altymų sekos, kurios yra panašios tarp gyvų rūšių. Promotorius, ribosomų surišimo vieta, replikacijos pradžia ir histono b altymo aminorūgščių seka yra keli konservuotų sekų pavyzdžiai. Priešingai, konsensuso sekos yra specifinės bazės arba aminorūgštys, kurios dažniau randamos tam tikroje konservuotoje sekoje. -10 dėžutės, -35 dėžutės E. coli promotoriaus, b altymų surišimo vietos, sujungimo vietos ir restrikcijos fermentų atpažinimo vietos yra keli konsensuso sekų pavyzdžiai. Taigi, tai yra skirtumo tarp išsaugotos ir konsensuso sekos santrauka.
